RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 PIGUQ9H490 435 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 VPS29Q9UBQ0 182 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1W2PRB8 838 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 SEC13P55735 322 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 PDPRQ8NCN5 879 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 NUS1Q96E22 293 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM59LQ9UK28 342 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 INSL6Q9Y581 213 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 TFECO14948 347 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 B3GALT2O43825 422 aa19.89■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 AP2A2O94973 939 aa19.89■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 NFKB2Q00653 900 aa19.89■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM198Q66K66 360 aa19.89■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 ART5Q96L15 291 aa19.89■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa19.89■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 CNPPD1Q9BV87 410 aa19.89■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 WDR26Q9H7D7 661 aa19.89■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 ATXN10Q9UBB4 475 aa19.89■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 ACTR1BP42025 376 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 ACTR1AP61163 376 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 GPR17Q13304 367 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 COX18Q8N8Q8 333 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 NPY6RQ99463 290 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 SLC17A6Q9P2U8 582 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 STYXL1Q9Y6J8 313 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 ECI2O75521 394 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 SLC7A1P30825 629 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 KHKP50053 298 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 CRISP3P54108 245 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 OGDHQ02218 1023 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 GALNT2Q10471 571 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 TXNDC8Q6A555 127 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 PYCR2Q96C36 320 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 UBXN7O94888 489 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFS1P28331 727 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 GMFBP60983 142 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 DMPKQ09013 629 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 RNF220Q5VTB9 566 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 NUDT13Q86X67 352 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 NATD1Q8N6N6 113 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 NEK7Q8TDX7 302 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 TAPBPLQ9BX59 468 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 TEX264Q9Y6I9 313 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 WASF2Q9Y6W5 498 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 SAGE2PA6NJ88 616 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC85CA6NKD9 419 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 DUXAA6NLW8 204 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 J3KR12 359 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 KCNQ1P51787 676 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 SLC30A8Q8IWU4 369 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF570Q96NI8 536 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 SLC32A1Q9H598 525 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 SLC7A8Q9UHI5 535 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD66B4E2M5 251 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 ANXA8P13928 327 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 BLMHQ13867 455 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 DIRAS2Q96HU8 199 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 COQ10BQ9H8M1 238 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 RICTORQ6R327 1708 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 AIREO43918 545 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 ACVRL1P37023 503 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 ACSBG2Q5FVE4 666 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 MEIOBQ8N635 442 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 OR4C6Q8NH72 309 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 PLEKHO2Q8TD55 490 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 CDH7Q9ULB5 785 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 KLF11O14901 512 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 AHSGP02765 367 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 IFNA6P05013 189 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJB1P25685 340 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 IL18R1Q13478 541 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 SERINC3Q13530 473 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 ARSIQ5FYB1 569 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 OR5K1Q8NHB7 308 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 GPR22Q99680 433 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 C9P02748 559 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 ALPIP09923 528 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 POU2F1P14859 743 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 HMGCS1Q01581 520 aa19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms