RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364072.1

RNU6-501P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 501, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-501P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-501P-201ENST00000364072 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 ZNF197O14709 1029 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 EML2O95834 649 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 EDN1P05305 212 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 SLC9A3P48764 834 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 LIG4P49917 911 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 PDX1P52945 283 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 PRKCZQ05513 592 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 GTDC1Q4AE62 458 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 FFAR4Q5NUL3 377 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 SLC16A9Q7RTY1 509 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 CFAP206Q8IYR0 622 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 SPDL1Q96EA4 605 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 GIMAP5Q96F15 307 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 NSL1Q96IY1 281 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 FNBP1Q96RU3 617 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 ASCL2Q99929 193 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 MORF4L1Q9UBU8 362 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 FAM169AQ9Y6X4 670 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 A0A1W2PPE2 198 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 A0A1W2PR64 198 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 PSMD14O00487 310 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 TRMUO75648 421 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 CGAP01215 116 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 IGLV1-44P01699 117 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 ADRB2P07550 413 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 FAM157CP0CG43 387 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 AKR1B1P15121 316 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 LMAN1P49257 510 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 KCNJ10P78508 379 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 PMP22Q01453 160 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 ITGA9Q13797 1035 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 IL11RAQ14626 422 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 C14orf177Q52M58 125 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 PHLDA2Q53GA4 152 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 SPDYCQ5MJ68 293 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 ARHGEF16Q5VV41 709 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 C16orf54Q6UWD8 224 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 TMEM139Q8IV31 216 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 NPEPL1Q8NDH3 523 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 TSPAN14Q8NG11 270 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 SLAMF9Q96A28 289 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 DHX58Q96C10 678 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 NXNL1Q96CM4 212 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 APOL6Q9BWW8 343 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 S1PR5Q9H228 398 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 OPA3Q9H6K4 179 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 Q9N2K0 584 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 SERINC1Q9NRX5 453 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 OLAHQ9NV23 265 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 DPP3Q9NY33 737 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 ANAPC2Q9UJX6 822 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 RIPK3Q9Y572 518 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-501P-201ENST00000364072 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 MEIS2O14770 477 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 AP2A2O94973 939 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 LDHCP07864 332 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 LINGO3P0C6S8 592 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 PFKFB1P16118 471 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 IL11P20809 199 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 CA6P23280 308 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 UBXN2AP68543 259 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 HSPB3Q12988 150 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 FCN2Q15485 313 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 TAF13Q15543 124 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 ELFN2Q5R3F8 820 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 CFAP58Q5T655 872 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 CYP4A22Q5TCH4 519 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 ZNF790Q6PG37 636 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 FAM198BQ6UWH4 519 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 CLEC4GQ6UXB4 293 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 TMPRSS11BQ86T26 416 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 PIGZQ86VD9 579 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 AVL9Q8NBF6 648 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 ZNF248Q8NDW4 579 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 DDHD1Q8NEL9 900 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 OR2T11Q8NH01 316 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 CCDC107Q8WV48 283 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 HPSE2Q8WWQ2 592 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 WBP2Q969T9 261 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 PRAC1Q96KF2 57 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-501P-201ENST00000364072 CCDC106Q9BWC9 280 aa3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms