RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 UFM1P61960 85 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 IRX4P78413 519 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 MECOMQ03112 1051 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 DMPKQ09013 629 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 BLMHQ13867 455 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TFDP3Q5H9I0 405 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 IL31Q6EBC2 164 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 NOTUMQ6P988 496 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 LCLAT1Q6UWP7 414 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 LINGO4Q6UY18 593 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 G2E3Q7L622 706 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 MOGAT3Q86VF5 341 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF130Q86XS8 419 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GALNT13Q8IUC8 556 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CEP97Q8IW35 865 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 MYCT1Q8N699 235 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 Q8N9L7 120 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR1L3Q8NH93 324 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 NSMAFQ92636 917 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CFAP57Q96MR6 1250 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 COG8Q96MW5 612 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM218AQ96MZ4 157 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 REEP2Q9BRK0 252 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 UBAC1Q9BSL1 405 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC28BQ9BUN5 200 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ABHD6Q9BV23 337 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 KIFC3Q9BVG8 833 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 VN1R1Q9GZP7 353 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM39BQ9GZU3 492 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 BRF2Q9HAW0 419 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSPYL4Q9UJ04 414 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 FBXW11Q9UKB1 542 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GTF3C4Q9UKN8 822 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 KLK12Q9UKR0 248 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GON4LQ3T8J9 2241 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 POGZQ7Z3K3 1410 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A1W2PQM1 296 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TTC36A6NLP5 189 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRRC53A6NM62 1247 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 E9PAM4 449 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 K7EQD1 137 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 NXPH4O95158 308 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRCPP42785 496 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 LBX1P52954 281 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 HERV-K104P61576 105 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CX3CL1P78423 397 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GAGE2BQ13066 116 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 EFR3AQ14156 821 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 POSTNQ15063 836 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM189A2Q15884 450 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF74Q16587 644 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GAGE2EQ4V326 116 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRIF1Q5T3J3 769 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GCNT6Q5T4J0 391 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 C20orf194Q5TEA3 1177 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADALQ6DHV7 355 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GAGE2AQ6NT46 116 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC174Q6PII3 467 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 PAMR1Q6UXH9 720 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 KSR2Q6VAB6 950 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TPRG1Q6ZUI0 275 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHMP1BQ7LBR1 199 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZER1Q7Z7L7 766 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM139Q8IV31 216 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSPYL6Q8N831 410 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR4Q3Q8NH05 313 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 LINC01006Q8NI28 216 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GTF3C6Q969F1 213 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC22A12Q96S37 553 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 APOL2Q9BQE5 337 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR2B2Q9GZK3 357 aa0.29□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms