RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327347.9

SEPHS1-201, Transcript of selenophosphate synthetase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEPHS1, Length 3,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPHS1-201ENST00000327347 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 GRIK2Q13002 908 aa16.86■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 PON2Q15165 354 aa16.86■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 TM6SF2Q9BZW4 377 aa16.86■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 VNN3Q9NY84 501 aa16.86■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa16.86■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 PKP3Q9Y446 797 aa16.86■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 KLK8O60259 260 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 SH3BGRLO75368 114 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 AKT1P31749 480 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 INAQ16352 499 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 CLLU1OSQ5K130 101 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 SUSD1Q6UWL2 747 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 MCOLN3Q8TDD5 553 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC35B4Q969S0 331 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 FKBP10Q96AY3 582 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 PSKH2Q96QS6 385 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 GPR63Q9BZJ6 419 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 WWOXQ9NZC7 414 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 GNPTGQ9UJJ9 305 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 PATJQ8NI35 1801 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 M0R3G1 203 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 CELF2O95319 508 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 FADS2O95864 444 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 PGRP06401 933 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 DCTP40126 519 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 GATMP50440 423 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 PPP2R2BQ00005 443 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 SYT16Q17RD7 645 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 SBSNQ6UWP8 590 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 TSSK3Q96PN8 268 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 INPP5KQ9BT40 448 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 GPR62Q9BZJ7 368 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 NDUFS2O75306 463 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 MYO1DO94832 1006 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 RHOCP08134 193 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 GKP32189 559 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 CLCN7P51798 805 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 NEK2P51955 445 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 DGKEP52429 567 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 TRAF3Q13114 568 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 INAVAQ3KP66 663 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 C8orf48Q96LL4 319 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 LATS2Q9NRM7 1088 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 MTRRQ9UBK8 725 aa16.85■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 A8MV72 311 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 hCG_2039718K7EN88 272 aa16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 MAPKAPK2P49137 400 aa16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 SPATS1Q496A3 300 aa16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 CES5AQ6NT32 575 aa16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 PAGE2Q7Z2X7 111 aa16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC22A16Q86VW1 577 aa16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 EID3Q8N140 333 aa16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 PEX13Q92968 403 aa16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 EID2BQ96D98 161 aa16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 C5orf42Q9H799 3197 aa16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 BCKDKO14874 412 aa16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 ASGR1P07306 291 aa16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 RASAL3Q86YV0 1011 aa16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 CDC26Q8NHZ8 85 aa16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 ULK4Q96C45 1275 aa16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 CPQQ9Y646 472 aa16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 PRSS21Q9Y6M0 314 aa16.84■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 IQCA1LA6NCM1 817 aa16.83■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 TAPBPO15533 448 aa16.83■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 NDUFB5O43674 189 aa16.83■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 NBNO60934 754 aa16.83■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 CREG1O75629 220 aa16.83■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 EPHA2P29317 976 aa16.83■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 ISL1P61371 349 aa16.83■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 ARHGEF7Q14155 803 aa16.83■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 DSC3Q14574 896 aa16.83■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.29
SEPHS1-201ENST00000327347 CATSPEREQ5SY80 951 aa16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms