RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321358.11

YBX1-201, Transcript of Y-box binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene YBX1, Length 1,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1-201ENST00000321358 SLC18A2Q05940 514 aa20.6■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.6■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 STPG1Q5TH74 334 aa20.6■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 AGBL2Q5U5Z8 902 aa20.6■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 CLEC14AQ86T13 490 aa20.6■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 GPSM1Q86YR5 675 aa20.6■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 SLC35F3Q8IY50 421 aa20.6■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 APOLD1Q96LR9 279 aa20.6■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 HGH1Q9BTY7 390 aa20.6■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 ALG9Q9H6U8 611 aa20.6■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 LAMA1P25391 3075 aa20.6■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 LRP4O75096 1905 aa20.59■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 FAM186AA6NE01 2351 aa20.59■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 SYCE1LA8MT33 242 aa20.59■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 GDF9O60383 454 aa20.59■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 GLB1P16278 677 aa20.59■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 CRHR1P34998 444 aa20.59■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 GMPRP36959 345 aa20.59■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 DLG1Q12959 904 aa20.59■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 PLCL1Q15111 1095 aa20.59■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa20.59■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 SH2D5Q6ZV89 423 aa20.59■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 ISCA2Q86U28 154 aa20.59■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 SFTPA2Q8IWL1 248 aa20.59■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 RHEBL1Q8TAI7 183 aa20.59■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 SLC38A3Q99624 504 aa20.59■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa20.59■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 LRIT1Q9P2V4 623 aa20.59■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa20.59■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 ARHGEF33A8MVX0 844 aa20.58■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 S100BP04271 92 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 CD59P13987 128 aa20.58■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 AP1S2P56377 157 aa20.58■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 EXOC3L1Q86VI1 746 aa20.58■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 NAXDQ8IW45 347 aa20.58■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 APOPT1Q96IL0 206 aa20.58■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 CAMK1GQ96NX5 476 aa20.58■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 SH3GL2Q99962 352 aa20.58■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 ARL15Q9NXU5 204 aa20.58■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 FTSJ1Q9UET6 329 aa20.58■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa20.58■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 OARD1Q9Y530 152 aa20.58■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa20.58■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 BDKRB1P46663 353 aa20.58■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 BANPQ8N9N5 519 aa20.58■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 OR9A1PQ8NGU1 263 aa20.58■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 LCN9Q8WX39 176 aa20.58■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 NAT6Q93015 286 aa20.58■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 PTERQ96BW5 349 aa20.58■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa20.58■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 CCDC138Q96M89 665 aa20.58■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 GPR78Q96P69 363 aa20.58■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 CDC6Q99741 560 aa20.58■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 RDH14Q9HBH5 336 aa20.58■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 ZNF358Q9NW07 568 aa20.58■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 MKS1Q9NXB0 559 aa20.58■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 PDE10AQ9Y233 779 aa20.58■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 BTBD3Q9Y2F9 522 aa20.58■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa20.57■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 ZNF839A8K0R7 811 aa20.57■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 SH3BP5O60239 455 aa20.57■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 KERAO60938 352 aa20.57■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 SPAG7O75391 227 aa20.57■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 HSD17B2P37059 387 aa20.57■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 GPR18Q14330 331 aa20.57■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 OR4D1Q15615 310 aa20.57■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 CCDC153Q494R4 210 aa20.57■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 SBSNQ6UWP8 590 aa20.57■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 TMEM26Q6ZUK4 368 aa20.57■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 ATL1Q8WXF7 558 aa20.57■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 ARL8AQ96BM9 186 aa20.57■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 EGFL8Q99944 293 aa20.57■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa20.57■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 UCK1Q9HA47 277 aa20.57■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 KCNK9Q9NPC2 374 aa20.57■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 CPED1A4D0V7 1026 aa20.56■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 PPM1DO15297 605 aa20.56■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 GUCA1CO95843 209 aa20.56■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 ANXA5P08758 320 aa20.56■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 CKMT1AP12532 417 aa20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms