RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308020.5

PTDSS2-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS2, Length 2,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-201ENST00000308020 DEFB115Q30KQ5 88 aa20.55■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 TTC23Q5W5X9 447 aa20.55■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 OPTCQ9UBM4 332 aa20.55■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 GOLGA8CPA6NN73 597 aa20.55■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 CXCR6O00574 342 aa20.55■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 SEC22BO75396 215 aa20.55■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 PRKACGP22612 351 aa20.55■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 BMXP51813 675 aa20.55■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 ARMC12Q5T9G4 340 aa20.55■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 GCNT7Q6ZNI0 430 aa20.55■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 APCDD1Q8J025 514 aa20.55■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 SPARTQ8N0X7 666 aa20.55■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 NAT16Q8N8M0 369 aa20.55■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 PLEKHA8Q96JA3 519 aa20.55■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC6A13Q9NSD5 602 aa20.55■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 INVSQ9Y283 1065 aa20.55■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 OARD1Q9Y530 152 aa20.55■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 A8MX80 341 aa20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 ULK1O75385 1050 aa20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 SOD2P04179 222 aa20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 RGS4P49798 205 aa20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 PPP2R2BQ00005 443 aa20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 SUSD1Q6UWL2 747 aa20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 CERS6Q6ZMG9 384 aa20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 NCLNQ969V3 563 aa20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 CSF3RQ99062 836 aa20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 ASB8Q9H765 288 aa20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 STOML2Q9UJZ1 356 aa20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 OR51B4Q9Y5P0 310 aa20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 HTR1AP08908 422 aa20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 MSH3P20585 1137 aa20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 GNPDA1P46926 289 aa20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 KCNAB2Q13303 367 aa20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 C6orf141Q5SZD1 244 aa20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 TPGS2Q68CL5 300 aa20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 RGL4Q8IZJ4 473 aa20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF555Q8NEP9 628 aa20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 NRBF2Q96F24 287 aa20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 OR52E6Q96RD3 313 aa20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 CD244Q9BZW8 370 aa20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 MAGEE1Q9HCI5 957 aa20.54■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 LOC730098B7Z3J9 87 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 J3QRK9 145 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 PLA2G16P53816 162 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF783Q6ZMS7 281 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 PIH1D2Q8WWB5 315 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 FBXL8Q96CD0 374 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 MYO19Q96H55 970 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 TMEM169Q96HH4 297 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 LRTM1Q9HBL6 345 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 GNPTGQ9UJJ9 305 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 CPQQ9Y646 472 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC28A1O00337 649 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 BCL10O95999 233 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 AGXTP21549 392 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 GSTM2P28161 218 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 MOGQ16653 247 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 CACHD1Q5VU97 1274 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 C16orf87Q6PH81 154 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 C10orf111Q8N326 155 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 ALG14Q96F25 216 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 RDH12Q96NR8 316 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 EXD2Q9NVH0 621 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 TBCCD1Q9NVR7 557 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 PDE10AQ9Y233 779 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 U3KQV3 271 aa20.53■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 HS6ST1O60243 411 aa20.52■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 PGLSO95336 258 aa20.52■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 CXCL10P02778 98 aa20.52■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 IL6P05231 212 aa20.52■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 DGKAP23743 735 aa20.52■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 CD47Q08722 323 aa20.52■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 NFATC2Q13469 925 aa20.52■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 TUBA3CQ13748 450 aa20.52■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 PON2Q15165 354 aa20.52■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 RUNDC3AQ59EK9 446 aa20.52■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa20.52■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa20.52■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 RBFAQ8N0V3 343 aa20.52■□□□□ 0.88
PTDSS2-201ENST00000308020 PJA1Q8NG27 643 aa20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.1 ms