RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 MAGEC3Q8TD91 643 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 ASB11Q8WXH4 323 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 RAD51AP1Q96B01 352 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 OGFRQ9NZT2 677 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF180Q9UJW8 692 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 CLCA2Q9UQC9 943 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 OR6C74A6NCV1 312 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGEF33A8MVX0 844 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 KRT38O76015 456 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 MT-CO3P00414 261 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 GCAP28676 217 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 CAPZBP47756 277 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 CFHR1Q03591 330 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 CCSMST1Q4G0I0 132 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 AMIGO1Q86WK6 493 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD49Q8WVL7 239 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 HRASLS2Q9NWW9 162 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 ICKQ9UPZ9 632 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 KRT87PA6NCN2 255 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 ZBTB14O43829 449 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 TPBGLP0DKB5 382 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 JUPP14923 745 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 MPSTP25325 297 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 SHMT2P34897 504 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 CDCP2Q5VXM1 449 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 OOSP2Q86WS3 158 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 TMPRSS12Q86WS5 348 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 GALNT15Q8N3T1 639 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 DHRS4Q9BTZ2 278 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 CACNA1AO00555 2505 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 FAM149AA5PLN7 773 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 GFYI3L273 518 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 SYF2O95926 243 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 C8GP07360 202 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC166P0CW27 439 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 CNTFP26441 200 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 CRABP2P29373 138 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 SERPINB8P50452 374 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 SQSTM1Q13501 440 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 GRB7Q14451 532 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 LGSNQ5TDP6 509 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 ARMC6Q6NXE6 501 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 IRGCQ6NXR0 463 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 ADGRD1Q6QNK2 874 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 IL17FQ96PD4 163 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 DEPDC7Q96QD5 511 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 SNX15Q9NRS6 342 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM9Q9P0T7 183 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 FETUBQ9UGM5 382 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 KLHL3Q9UH77 587 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 OR5K3A6NET4 321 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 CSO75390 466 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 KRT37O76014 449 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 SLC35E2BP0CK96 405 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 CYP2A7P20853 494 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 TYK2P29597 1187 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 RAB28P51157 221 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 GFERP55789 205 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 PRKAA1Q13131 559 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 SNAP47Q5SQN1 464 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM71Q6P5X7 295 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 PLXDC1Q8IUK5 500 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 SPATA6LQ8N4H0 392 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 RAB42Q8N4Z0 105 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 TGM7Q96PF1 710 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 DPYSL5Q9BPU6 564 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 SEMA6CQ9H3T2 930 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 GSAPA4D1B5 854 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 FAM221BA6H8Z2 402 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 SMIM23A6NLE4 172 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM49D1C9J1S8 452 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 BTN3A3O00478 584 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 BTN3A1O00481 513 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 GMPRP36959 345 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 PDX1P52945 283 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD4-201ENST00000306324 PPP1CAP62136 330 aa21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms