RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 TSPAN11A1L157 253 aa23.41■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 SOBPA7XYQ1 873 aa23.41■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 TTC34A8MYJ7 566 aa23.41■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 UPK3BL1B0FP48 263 aa23.41■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 UPK3BL2E5RIL1 263 aa23.41■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 SLC16A5O15375 505 aa23.41■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 AHCYL1O43865 530 aa23.41■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 MTX2O75431 263 aa23.41■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 NTHL1P78549 312 aa23.41■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa23.41■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa23.41■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 CBR4Q8N4T8 237 aa23.41■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 POF1BQ8WVV4 589 aa23.41■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 SORCS1Q8WY21 1168 aa23.41■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 OTUB2Q96DC9 234 aa23.41■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 C9orf16Q9BUW7 83 aa23.41■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 PCDH12Q9NPG4 1184 aa23.41■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa23.41■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 CYP2A7P20853 494 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 NFKBIAP25963 317 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 BMPR1AP36894 532 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 NNMTP40261 264 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 RPL5P46777 297 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 SLC6A12P48065 614 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 CNPY1Q3B7I2 92 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 NECAB2Q7Z6G3 386 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 TBC1D21Q8IYX1 336 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 ACPTQ9BZG2 426 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 EPB41L1Q9H4G0 881 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 SLC24A3Q9HC58 644 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 NOTCH4Q99466 2003 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 ENO4A6NNW6 628 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 XYLBO75191 536 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 AP2A2O94973 939 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 HOXA9P31269 272 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 ATP6AP1Q15904 470 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 ARSIQ5FYB1 569 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 NHSL2Q5HYW2 709 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 PRSS36Q5K4E3 855 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 MFSD2AQ8NA29 543 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 BIRC7Q96CA5 298 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 NSMCE2Q96MF7 247 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 ANKRD60Q9BZ19 345 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 CLMPQ9H6B4 373 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 NDUFA13Q9P0J0 144 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa23.39■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 GFYI3L273 518 aa23.39■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 PDYNP01213 254 aa23.39■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 IL6P05231 212 aa23.39■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 ETV3P41162 512 aa23.39■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 PLIN5Q00G26 463 aa23.39■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 APOFQ13790 326 aa23.39■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 PTCHD3Q3KNS1 767 aa23.39■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 GLYATQ6IB77 296 aa23.39■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 SUSD1Q6UWL2 747 aa23.39■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 Q6ZVL8 140 aa23.39■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 NEK10Q6ZWH5 1172 aa23.39■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 ELMO1Q92556 727 aa23.39■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 ZSWIM3Q96MP5 696 aa23.39■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 ELOVL6Q9H5J4 265 aa23.39■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 C8orf4Q9NR00 106 aa23.39■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 RAD18Q9NS91 495 aa23.39■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 PADI4Q9UM07 663 aa23.39■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 SNX6Q9UNH7 406 aa23.39■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 SLC8A2Q9UPR5 921 aa23.39■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa23.39■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa23.38■■□□□ 1.33
TRIM54-201ENST00000296098 DFNA5O60443 496 aa23.38■■□□□ 1.33
TRIM54-201ENST00000296098 AP1S2P56377 157 aa23.38■■□□□ 1.33
TRIM54-201ENST00000296098 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
TRIM54-201ENST00000296098 MAPKAPK3Q16644 382 aa23.38■■□□□ 1.33
TRIM54-201ENST00000296098 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
TRIM54-201ENST00000296098 SPANXN4Q5MJ08 99 aa23.38■■□□□ 1.33
TRIM54-201ENST00000296098 TMTC4Q5T4D3 741 aa23.38■■□□□ 1.33
TRIM54-201ENST00000296098 KRT80Q6KB66 452 aa23.38■■□□□ 1.33
TRIM54-201ENST00000296098 TRAM1L1Q8N609 369 aa23.38■■□□□ 1.33
TRIM54-201ENST00000296098 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa23.38■■□□□ 1.33
TRIM54-201ENST00000296098 DDHD1Q8NEL9 900 aa23.38■■□□□ 1.33
TRIM54-201ENST00000296098 SELENOMQ8WWX9 145 aa23.38■■□□□ 1.33
TRIM54-201ENST00000296098 GTF2H4Q92759 462 aa23.38■■□□□ 1.33
TRIM54-201ENST00000296098 RAD9AQ99638 391 aa23.38■■□□□ 1.33
TRIM54-201ENST00000296098 VAPAQ9P0L0 249 aa23.38■■□□□ 1.33
TRIM54-201ENST00000296098 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
TRIM54-201ENST00000296098 IL36AQ9UHA7 158 aa23.38■■□□□ 1.33
TRIM54-201ENST00000296098 OAZ3Q9UMX2 235 aa23.38■■□□□ 1.33
TRIM54-201ENST00000296098 PDLIM1O00151 329 aa23.38■■□□□ 1.33
TRIM54-201ENST00000296098 FTH1P02794 183 aa23.38■■□□□ 1.33
TRIM54-201ENST00000296098 TFAP2AP05549 437 aa23.38■■□□□ 1.33
TRIM54-201ENST00000296098 CTSLP07711 333 aa23.38■■□□□ 1.33
TRIM54-201ENST00000296098 TCF3P15923 654 aa23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms