RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293748.9

SYNGAP1-201, Transcript of synaptic Ras GTPase activating protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SYNGAP1, Length 4,556 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1-201ENST00000293748 RPL4P36578 427 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
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SYNGAP1-201ENST00000293748 LAPTM4BQ86VI4 370 aa11.64□□□□□ -0.55
SYNGAP1-201ENST00000293748 LRRN4Q8WUT4 740 aa11.64□□□□□ -0.55
SYNGAP1-201ENST00000293748 TP53INP1Q96A56 240 aa11.64□□□□□ -0.55
SYNGAP1-201ENST00000293748 FAM84AQ96KN4 292 aa11.64□□□□□ -0.55
SYNGAP1-201ENST00000293748 BCO2Q9BYV7 579 aa11.64□□□□□ -0.55
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SYNGAP1-201ENST00000293748 COL4A6Q14031 1691 aa11.64□□□□□ -0.55
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SYNGAP1-201ENST00000293748 SLC22A17Q8WUG5 538 aa11.64□□□□□ -0.55
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SYNGAP1-201ENST00000293748 MARCH7Q9H992 704 aa11.64□□□□□ -0.55
SYNGAP1-201ENST00000293748 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
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SYNGAP1-201ENST00000293748 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa11.63□□□□□ -0.55
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SYNGAP1-201ENST00000293748 HEXDCQ8WVB3 486 aa11.63□□□□□ -0.55
SYNGAP1-201ENST00000293748 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
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SYNGAP1-201ENST00000293748 TBX1O43435 398 aa11.63□□□□□ -0.55
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SYNGAP1-201ENST00000293748 OR10T2Q8NGX3 314 aa11.63□□□□□ -0.55
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SYNGAP1-201ENST00000293748 DSN1Q9H410 356 aa11.63□□□□□ -0.55
SYNGAP1-201ENST00000293748 GDE1Q9NZC3 331 aa11.63□□□□□ -0.55
SYNGAP1-201ENST00000293748 GULP1Q9UBP9 304 aa11.63□□□□□ -0.55
SYNGAP1-201ENST00000293748 DNMT3LQ9UJW3 386 aa11.63□□□□□ -0.55
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SYNGAP1-201ENST00000293748 FAM172BPA6NC97 362 aa11.63□□□□□ -0.55
SYNGAP1-201ENST00000293748 GABRDO14764 452 aa11.63□□□□□ -0.55
SYNGAP1-201ENST00000293748 MT-ND1P03886 318 aa11.63□□□□□ -0.55
SYNGAP1-201ENST00000293748 ASLP04424 464 aa11.63□□□□□ -0.55
SYNGAP1-201ENST00000293748 POU2F2P09086 479 aa11.63□□□□□ -0.55
SYNGAP1-201ENST00000293748 WEE1P30291 646 aa11.63□□□□□ -0.55
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SYNGAP1-201ENST00000293748 INCA1Q0VD86 236 aa11.63□□□□□ -0.55
SYNGAP1-201ENST00000293748 E2F2Q14209 437 aa11.63□□□□□ -0.55
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SYNGAP1-201ENST00000293748 APOLD1Q96LR9 279 aa11.63□□□□□ -0.55
SYNGAP1-201ENST00000293748 CXCL16Q9H2A7 254 aa11.63□□□□□ -0.55
SYNGAP1-201ENST00000293748 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SYNGAP1-201ENST00000293748 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SYNGAP1-201ENST00000293748 TMEM9Q9P0T7 183 aa11.63□□□□□ -0.55
SYNGAP1-201ENST00000293748 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SYNGAP1-201ENST00000293748 CDH7Q9ULB5 785 aa11.63□□□□□ -0.55
SYNGAP1-201ENST00000293748 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SYNGAP1-201ENST00000293748 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
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