RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 QRFPRQ96P65 431 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ZNF347Q96SE7 839 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PKMYT1Q99640 499 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 TOR3AQ9H497 397 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 RDH14Q9HBH5 336 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SAGE2PA6NJ88 616 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 MAGEB17A8MXT2 336 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 INPPL1O15357 1258 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 MT-ND1P03886 318 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 IL12AP29459 219 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 HMGCLP35914 325 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 MAPK10P53779 464 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ECT2LQ008S8 904 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 TRIM40Q6P9F5 258 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 APOLD1Q96LR9 279 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PTPN18Q99952 460 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SPO11Q9Y5K1 396 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 WDR90Q96KV7 1748 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PLK4O00444 970 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ADAMDEC1O15204 470 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CLPXO76031 633 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PRKD3O94806 890 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SEC24AO95486 1093 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SNAP29O95721 258 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 TRBC1P01850 177 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 RETP07949 1114 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ACRV1P26436 265 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 DGKQP52824 942 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 OR4D2P58180 307 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 DSC1Q08554 894 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 LAPTM5Q13571 262 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 RETREG3Q86VR2 466 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 P2RY8Q86VZ1 359 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PGBD5Q8N414 524 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SMYD1Q8NB12 490 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 Q96MT0 163 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CCDC115Q96NT0 180 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 TSSK3Q96PN8 268 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SLC2A11Q9BYW1 496 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PREBQ9HCU5 417 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ARVCFO00192 962 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 OR1I1O60431 355 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 MPZL2O60487 215 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ITGB1P05556 798 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 LAG3P18627 525 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 FPR1P21462 350 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PPM1AP35813 382 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ERVPABLB-1P60509 514 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PRKCZQ05513 592 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CLLU1OSQ5K130 101 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 OR2T5Q6IEZ7 315 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 FUNDC1Q8IVP5 155 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 OR2T29Q8NH02 315 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SGIP1Q9BQI5 828 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 MAP10Q9P2G4 905 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 KLHL3Q9UH77 587 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 COQ6Q9Y2Z9 468 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 KCNE2Q9Y6J6 123 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 F8W810 466 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 COCHO43405 550 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 NADKO95544 446 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 KRT8P05787 483 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 HOXC8P31273 242 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 HNF4AP41235 474 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SMIM11AP58511 58 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 NFATC2Q13469 925 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 UGT3A2Q3SY77 523 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PAGE3Q5JUK9 113 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 HMBOX1Q6NT76 420 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 NEK5Q6P3R8 708 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 MDGA1Q8NFP4 955 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CLHC1Q8NHS4 586 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 TRIB2Q92519 343 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SLC30A3Q99726 388 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 FEM1AQ9BSK4 669 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 TTLL2Q9BWV7 592 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 OLAHQ9NV23 265 aa8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms