RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 MYBPC1Q00872 1141 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 BNC1Q01954 994 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 NDUFA5Q16718 116 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 SIRPB2Q5JXA9 342 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 MBLAC2Q68D91 279 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 CNKSR3Q6P9H4 555 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 C7orf61Q8IZ16 206 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 OR10H5Q8NGA6 315 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 GIPC3Q8TF64 312 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 COX4I2Q96KJ9 171 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF354BQ96LW1 612 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 DUSP26Q9BV47 211 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 KLF11O14901 512 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 CASKO14936 926 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 CHST10O43529 356 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 OR5F1O95221 314 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 UGT1A6P19224 532 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 CD247P20963 164 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 UGT1A1P22309 533 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 UGT1A4P22310 534 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 IL12AP29459 219 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 UGT1A3P35503 534 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 PDGFRLQ15198 375 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 LIN52Q52LA3 116 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 C6orf52Q5T4I8 152 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 LIN54Q6MZP7 749 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 BORCS5Q969J3 196 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 TRIM8Q9BZR9 551 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 OR2AG1Q9H205 316 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 MEIS3P2A8K0S8 358 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 A8MT66 165 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF487B1APH4 448 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 ACRP10323 421 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 PEX2P28328 305 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 PTPN5P54829 565 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 SERINC3Q13530 473 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 LRTOMTQ8WZ04 291 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 C12orf66Q96MD2 445 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM209Q96SK2 561 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 CYP2S1Q96SQ9 504 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 LRRC3Q9BY71 257 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 CERS4Q9HA82 394 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 NENFQ9UMX5 172 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 IRAK3Q9Y616 596 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 AQP12BA6NM10 295 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 TBX10O75333 385 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 RFPL1O75677 317 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 FADS2O95864 444 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 TFPIP10646 304 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 ETS2P15036 469 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 PRPS1L1P21108 318 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 MAGEA11P43364 429 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 OMPP47874 163 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 KCNQ1P51787 676 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 LDLRAD1Q5T700 205 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 AQP12AQ8IXF9 295 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 C5orf34Q96MH7 638 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 OR52B2Q96RD2 323 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 GPR22Q99680 433 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 FBXW2Q9UKT8 454 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 ACVRL1P37023 503 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 HSPB3Q12988 150 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 TXNDC8Q6A555 127 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 METTL21AQ8WXB1 218 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 CHID1Q9BWS9 393 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 ANKRD66B4E2M5 251 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 HAS3O00219 553 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 RAP2AP10114 183 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 BLKP51451 505 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 MINDY4Q4G0A6 757 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 PIK3R6Q5UE93 754 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 SLCO6A1Q86UG4 719 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 TTLQ8NG68 377 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 ARNTL2Q8WYA1 636 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 SRMSQ9H3Y6 488 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 IL1RAPQ9NPH3 570 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 MYH7BA7E2Y1 1941 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 CNMDO75829 334 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 PRKCGP05129 697 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 AKT2P31751 481 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 CDH12P55289 794 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 C1QTNF8P60827 252 aa11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms