RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 OR6C2Q9NZP2 312 aa20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 SLC5A10A0PJK1 596 aa20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 OR51F1A6NGY5 319 aa20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 FDFT1P37268 417 aa20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 PTCHD3Q3KNS1 767 aa20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 SYTL3Q4VX76 610 aa20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 FAM198BQ6UWH4 519 aa20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 MED25Q71SY5 747 aa20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM139Q8IV31 216 aa20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 OR5K2Q8NHB8 316 aa20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 HDAC10Q969S8 669 aa20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 OR2A14Q96R47 310 aa20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 DHRS4Q9BTZ2 278 aa20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 ETNK1Q9HBU6 452 aa20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 RIMKLBQ9ULI2 386 aa20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 PADI2Q9Y2J8 665 aa20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 NAV2Q8IVL1 2488 aa20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 VPS4BO75351 444 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 CEACAM4O75871 244 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 SUN1O94901 812 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 CD63P08962 238 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 UGT2B7P16662 529 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 ADRA1DP25100 572 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 RRADP55042 308 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 NCF4Q15080 339 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 NLRP9Q7RTR0 991 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 HPS6Q86YV9 775 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 OR13J1Q8NGT2 312 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 RANBP9Q96S59 729 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 DESI2Q9BSY9 194 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 FAM60AQ9NP50 221 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 VPS4AQ9UN37 437 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 E7EVH7 732 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 OR2B3O76000 313 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 IFNB1P01574 187 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 TSTD2Q5T7W7 516 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 SEL1L2Q5TEA6 688 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 AFTPHQ6ULP2 937 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 RAB43Q86YS6 212 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 ZBTB2Q8N680 514 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 OR4L1Q8NH43 312 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 CPT1CQ8TCG5 803 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 ATG4AQ8WYN0 398 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 IP6K3Q96PC2 410 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 TSSK1BQ9BXA7 367 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 IMPACTQ9P2X3 320 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF148Q9UQR1 794 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 MAST4O15021 2626 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 A0A0J9YY10 115 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 A0A0U1RQJ8 604 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 ISM1B1AKI9 464 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF185O15231 689 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 LIASO43766 372 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 OR1I1O60431 355 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 DPM1O60762 260 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 GOT2P00505 430 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 SSPNQ14714 243 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 KIR2DS3Q14952 304 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 OASLQ15646 514 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 NADK2Q4G0N4 442 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 FAM69BQ5VUD6 431 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 MLIPQ5VWP3 458 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 NAPRTQ6XQN6 538 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 TRIM73Q86UV7 250 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 FDCSPQ8NFU4 85 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 OR6P1Q8NGX9 317 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 SPHK1Q9NYA1 384 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-201ENST00000250495 LRRK2Q5S007 2527 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 TPBGLP0DKB5 382 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 GABRA4P48169 554 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 ACVR1Q04771 509 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 ZIC1Q15915 447 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 SLC5A12Q1EHB4 618 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 RHBDD2Q6NTF9 364 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 TLDC1Q6P9B6 456 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 GLIS1Q8NBF1 620 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 GALNT11Q8NCW6 608 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 PROKR1Q8TCW9 393 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 ASZ1Q8WWH4 475 aa20.32■□□□□ 0.84
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