RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 NEMP2A6NFY4 417 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 MATN4O95460 622 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 PGGT1BP53609 377 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 MAXP61244 160 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R3AQ16821 1122 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC36A3Q495N2 470 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 DOK1Q99704 481 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 IL36AQ9UHA7 158 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS4BO75351 444 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 HMOX2P30519 316 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 PLK5Q496M5 336 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF678Q5SXM1 525 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZNX1 250 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 HDDC3Q8N4P3 179 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP25.78■■□□□ 1.72
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CAPNS1-201ENST00000246533 GANCQ8TET4 914 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 ARRDC3Q96B67 414 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 HEPHQ9BQS7 1158 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 FBRSQ9HAH7 460 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP4F12Q9HCS2 524 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 CKMT2P17540 419 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
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CAPNS1-201ENST00000246533 ATP6AP1Q15904 470 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 SPRED1Q7Z699 444 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 MIER2Q8N344 545 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 FATE1Q969F0 183 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 OLFM1Q99784 485 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 VWA7Q9Y334 891 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 KNL1Q8NG31 2342 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC7A4O43246 635 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 CBFA2T3O75081 653 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF217O75362 1048 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 RASAL1O95294 804 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 UMPSP11172 480 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP6V1B2P21281 511 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 CNR2P34972 360 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 PTGER3P43115 390 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 HERVK_113P63132 956 aa25.77■■□□□ 1.72
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CAPNS1-201ENST00000246533 HECTD2Q5U5R9 776 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 ARMCX6Q7L4S7 300 aa25.77■■□□□ 1.72
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CAPNS1-201ENST00000246533 RHBDL2Q9NX52 303 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM9Q9P0T7 183 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF292O60281 2723 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0J9YYE9 177 aa25.76■■□□□ 1.72
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CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 NAA20P61599 178 aa25.76■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 GRIK2Q13002 908 aa25.76■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF786Q8N393 782 aa25.76■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 SMYD1Q8NB12 490 aa25.76■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS50Q96JG6 964 aa25.76■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR174Q9BXC1 333 aa25.76■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM186AA6NE01 2351 aa25.76■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 UGT2B4P06133 528 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 C5AR1P21730 350 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 CD6P30203 668 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
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CAPNS1-201ENST00000246533 IHHQ14623 411 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 UGT3A2Q3SY77 523 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 TRPV3Q8NET8 790 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM54Q9BYV2 358 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A51Q9H1U9 297 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD36A6QL64 1941 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 NME4O00746 187 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 IGLV3-19P01714 112 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 DCKP27707 260 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 CCT8P50990 548 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF19Q2TAC6 998 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 LAYNQ6UX15 382 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 ASCL5Q7RTU5 278 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 PLPP6Q8IY26 295 aa25.75■■□□□ 1.71
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