RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 PLAGL1Q9UM63 463 aa21.63■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa21.62■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 C9orf172C9J069 976 aa21.62■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 E5RI56 91 aa21.62■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 BTN3A1O00481 513 aa21.62■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 C1orf105O95561 183 aa21.62■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 JMJD7P0C870 316 aa21.62■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 MAGEA4P43358 317 aa21.62■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 CDKN2DP55273 166 aa21.62■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 KYNUQ16719 465 aa21.62■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 CCSMST1Q4G0I0 132 aa21.62■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 CAPN12Q6ZSI9 719 aa21.62■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 RASGRP3Q8IV61 690 aa21.62■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 PALM2Q8IXS6 379 aa21.62■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa21.62■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 FGF11Q92914 225 aa21.62■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 ZMYND15Q9H091 742 aa21.62■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 L2HGDHQ9H9P8 463 aa21.62■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa21.62■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 RAXQ9Y2V3 346 aa21.62■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa21.62■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 EFCAB7A8K855 629 aa21.61■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 B4E171 279 aa21.61■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 CD9P21926 228 aa21.61■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 TSPAN7P41732 249 aa21.61■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 PGGT1BP53609 377 aa21.61■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 CUL1Q13616 776 aa21.61■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 KLHL38Q2WGJ6 581 aa21.61■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 CACHD1Q5VU97 1274 aa21.61■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa21.61■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa21.61■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 INPP5DQ92835 1189 aa21.61■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 USP7Q93009 1102 aa21.61■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 CCDC68Q9H2F9 335 aa21.61■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 FAM114A2Q9NRY5 505 aa21.61■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 CIDEBQ9UHD4 219 aa21.61■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 POMT2Q9UKY4 750 aa21.61■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 ADAMTS20P59510 1910 aa21.61■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa21.6■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa21.6■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 KRT87PA6NCN2 255 aa21.6■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 NVLO15381 856 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 SLC5A2P31639 672 aa21.6■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 SEPHS1P49903 392 aa21.6■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 MAPK10P53779 464 aa21.6■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 MC2RQ01718 297 aa21.6■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 ST3GAL2Q16842 350 aa21.6■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa21.6■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 CCDC25Q86WR0 208 aa21.6■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa21.6■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 LINC01555Q8NAE3 123 aa21.6■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 SLC41A2Q96JW4 573 aa21.6■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 SPHK1Q9NYA1 384 aa21.6■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 FOXJ2Q9P0K8 574 aa21.6■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 ZFATQ9P243 1243 aa21.6■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 FAM159BA6NKW6 160 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 PRAMEF10O60809 474 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 NELFEP18615 380 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 PKLRP30613 574 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 BDKRB1P46663 353 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 SH3BP2P78314 561 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 NEK10Q6ZWH5 1172 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 SLC26A11Q86WA9 606 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 IL17FQ96PD4 163 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 TAAR9Q96RI9 348 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 CD180Q99467 661 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 OLFM1Q99784 485 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 B3GNT4Q9C0J1 378 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 THSD1Q9NS62 852 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 ACSL6Q9UKU0 697 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 TLCD2A6NGC4 264 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 VPS26AO75436 327 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 RASSF9O75901 435 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 GSTA2P09210 222 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 FDXRP22570 491 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 SHMT2P34897 504 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 HECTD2Q5U5R9 776 aa21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms