RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		7.12	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		7.12	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		7.12	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		7.12	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		7.12	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM245	Q9H330	911 aa		7.12	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		7.12	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	WHRN	Q9P202	907 aa		7.12	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	OR1A2	Q9Y585	309 aa		7.12	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A0G2JND7	137 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495		A6NL46	340 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CAPN14	A8MX76	684 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495		H0YJX3	145 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	MTSS1	O43312	755 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ZMPSTE24	O75844	475 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	PIAS1	O75925	651 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SERPINF2	P08697	491 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ITIH1	P19827	911 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	PTPRD	P23468	1912 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	P2RY2	P41231	377 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	COPA	P53621	1224 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CAV1	Q03135	178 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF846	Q147U1	533 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	POU6F1	Q14863	301 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CES3	Q6UWW8	571 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TTC13	Q8NBP0	860 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	FRS2	Q8WU20	508 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SCAMP4	Q969E2	229 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TP53INP1	Q96A56	240 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ARRDC3	Q96B67	414 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	BIRC7	Q96CA5	298 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	IER2	Q9BTL4	223 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	FICD	Q9BVA6	458 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	FBXO10	Q9UK96	956 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	NUP50	Q9UKX7	468 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SOX13	Q9UN79	622 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	OR5K3	A6NET4	321 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	C3orf80	F5H4A9	247 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	GIPC1	O14908	333 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	PRNP	P04156	253 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	NR4A1	P22736	598 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	DCK	P27707	260 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	RRM2	P31350	389 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC26A3	P40879	764 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	GRIA1	P42261	906 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	NDST2	P52849	883 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	AIF1	P55008	147 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	OLR1	P78380	273 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	OCA2	Q04671	838 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	STX3	Q13277	289 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	C1orf61	Q13536	156 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CCNI	Q14094	377 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGEF7	Q14155	803 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SQLE	Q14534	574 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SHE	Q5VZ18	495 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	XKR5	Q6UX68	686 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC25	Q86WR0	208 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TDRP	Q86YL5	185 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF567	Q8N184	647 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	VPS33A	Q96AX1	596 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CLDN23	Q96B33	292 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SNX18	Q96RF0	628 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF347	Q96SE7	839 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	PPCS	Q9HAB8	311 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	POLH	Q9Y253	713 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495		H3BNH8	94 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495		J3QRK9	145 aa		7.11	□□□□□ -1.27

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