RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 H3BM21 787 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 DNM1LO00429 736 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 MPP1Q00013 466 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 GK5Q6ZS86 529 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ARL14Q8N4G2 192 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 HSFY1Q96LI6 401 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 IGSF9Q9P2J2 1179 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 KERAO60938 352 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ARP10275 920 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 RAB4AP20338 218 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 POLE4Q9NR33 117 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 FFAR3O14843 346 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 GPR42O15529 346 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 KIR3DL1P43629 444 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 TIGD6Q17RP2 521 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 STYK1Q6J9G0 422 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ZER1Q7Z7L7 766 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 PNPOQ9NVS9 261 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 MKS1Q9NXB0 559 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 GNG13Q9P2W3 67 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 POFUT2Q9Y2G5 429 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 A8MXE2 369 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 RAP2AP10114 183 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 LAMP2P13473 410 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 AMD1P17707 334 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 HSD11B1P28845 292 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 RARRES1P49788 294 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 PTP4A2Q12974 167 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 LINGO1Q96FE5 620 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 LRTM1Q9HBL6 345 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SPAG17Q6Q759 2223 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 CD79BP40259 229 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 GNPDA1P46926 289 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 TATDN1Q6P1N9 297 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC57Q8N9N7 239 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 CXorf40AQ8TE69 158 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 CXorf40BQ96DE9 158 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 OMDQ99983 421 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ACTR3BQ9P1U1 418 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 MON2Q7Z3U7 1717 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SLC35G6P0C7Q6 338 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 PGAM2P15259 253 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 LDLRAP1Q5SW96 308 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 PDSS1Q5T2R2 415 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SLC27A1Q6PCB7 646 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 PIGKQ92643 395 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 FKBP10Q96AY3 582 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 BORCS8Q96FH0 119 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 COPS4Q9BT78 406 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 RNF38Q9H0F5 515 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 RGCCQ9H4X1 137 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ARL6IP5O75915 188 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 MT-ND2P03891 347 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 IFI30P13284 250 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 COL26A1Q96A83 441 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 TAAR1Q96RJ0 339 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 LACTBL1A8MY62 500 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 RAPSNQ13702 412 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 PCK2Q16822 640 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 LGI2Q8N0V4 545 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
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