RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 TFDP2Q14188 446 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 LRRC14Q15048 493 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 CHRNA6Q15825 494 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 MSS51Q4VC12 460 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 YIF1BQ5BJH7 314 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 EFHC2Q5JST6 749 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 FNBP1LQ5T0N5 605 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 LCN1P1Q5VSP4 162 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 MLIPQ5VWP3 458 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 TMEM65Q6PI78 240 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 PRSS42Q7Z5A4 293 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 ACOT1Q86TX2 421 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 PTP4A1Q93096 173 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 FAF2Q96CS3 445 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 RTP4Q96DX8 246 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 TXNDC15Q96J42 360 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 TEX12Q9BXU0 123 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 SLC22A4Q9H015 551 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 ARL8BQ9NVJ2 186 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 IGSF9Q9P2J2 1179 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 IL19Q9UHD0 177 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 CPQQ9Y646 472 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 A0A1W2PRG6 482 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 LEUTXA8MZ59 168 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 B4E171 279 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 DVL2O14641 736 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 MDM4O15151 490 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 DOK2O60496 412 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 EFCAB14O75071 495 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 SEC22BO75396 215 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 KRT36O76013 467 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 TMEM63AO94886 807 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 TPMTP51580 245 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 ARL4CP56559 192 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 FADDQ13158 208 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 BHLHB9Q6PI77 547 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 GPR65Q8IYL9 337 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 ADGRF2Q8IZF7 708 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 MAGEB18Q96M61 343 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 AGAP2Q99490 1192 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 OSMRQ99650 979 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 ACTR6Q9GZN1 396 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 KLC2Q9H0B6 622 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 SLC6A15Q9H2J7 730 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 RXFP1Q9HBX9 757 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 KCNK9Q9NPC2 374 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 ZSCAN32Q9NX65 697 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 TOR4AQ9NXH8 423 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 TAS2R3Q9NYW6 316 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 HES2Q9Y543 173 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 FAM47DPA6NHR8 397 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 PIK3R2O00459 728 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 SLC31A2O15432 143 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 F9P00740 461 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 IGHV2-70P01814 119 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 UMPSP11172 480 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 KCNE1P15382 129 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 RAB4AP20338 218 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 TGM2P21980 687 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 CD79BP40259 229 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 STAT5AP42229 794 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 RAB13P51153 203 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 DCDC1P59894 354 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 ZP2Q05996 745 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 BAMBIQ13145 260 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 ADGRE1Q14246 886 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 TMED2Q15363 201 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 UGT2A3Q6UWM9 527 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 NPNTQ6UXI9 565 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 SNX20Q7Z614 316 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 LINC00523Q86TU6 105 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 PDIK1LQ8N165 341 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 THEM5Q8N1Q8 247 aa7.49□□□□□ -1.21
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