RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596522.1

FCHO1-215, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-215	ENST00000596522	MPC1L	P0DKB6	136 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	ECHS1	P30084	290 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	LIMK2	P53671	638 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	CAMK2B	Q13554	666 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	LSMEM2	Q8N112	164 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	GPATCH11	Q8N954	259 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	LCN9	Q8WX39	176 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	CMKLR1	Q99788	373 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	PDP2	Q9P2J9	529 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	OR5K3	A6NET4	321 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF839	A8K0R7	811 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	THRA	P10827	490 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	SLC12A2	P55011	1212 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	GPX6	P59796	221 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	SP140	Q13342	867 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	GRTP1	Q5TC63	336 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	CD200R1	Q8TD46	325 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	NCSTN	Q92542	709 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	GPR21	Q99679	349 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	HGH1	Q9BTY7	390 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	FUT8	Q9BYC5	575 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	NFU1	Q9UMS0	254 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	VWA7	Q9Y334	891 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	SPEG	Q15772	3267 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	ACACB	O00763	2458 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	MATN4	O95460	622 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	C9	P02748	559 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	TUBB	P07437	444 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	ABHD2	P08910	425 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	FDXR	P22570	491 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	GABRB3	P28472	473 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	CSF2RB	P32927	897 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	HSD17B2	P37059	387 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	RAB28	P51157	221 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	PDX1	P52945	283 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	POU4F1	Q01851	419 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	KYNU	Q16719	465 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	PHF19	Q5T6S3	580 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	KMT5C	Q86Y97	462 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	FBF1	Q8TES7	1133 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	UBXN4	Q92575	508 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	NDN	Q99608	321 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	RBBP8	Q99708	897 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	RDH14	Q9HBH5	336 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	MED16	Q9Y2X0	877 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-215	ENST00000596522	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-215	ENST00000596522	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-215	ENST00000596522	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		13.77	□□□□□ -0.21

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