RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 ERVK-10P10266 1014 aa20.34■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 PKMP14618 531 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 ITPKBP27987 946 aa20.34■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM164Q5U3C3 297 aa20.34■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 ARMC6Q6NXE6 501 aa20.34■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa20.34■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 SPACA3Q8IXA5 215 aa20.34■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 TBC1D21Q8IYX1 336 aa20.34■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 BBOF1Q8ND07 529 aa20.34■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 OR5K2Q8NHB8 316 aa20.34■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 FAM136AQ96C01 138 aa20.34■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 LRRC39Q96DD0 335 aa20.34■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 CFAP36Q96G28 342 aa20.34■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 XKR8Q9H6D3 395 aa20.34■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 FBXO5Q9UKT4 447 aa20.34■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa20.34■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 TEX264Q9Y6I9 313 aa20.34■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa20.33■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 NDC80O14777 642 aa20.33■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 KPNA5O15131 536 aa20.33■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 MPP1Q00013 466 aa20.33■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 MC2RQ01718 297 aa20.33■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 ANKS6Q68DC2 871 aa20.33■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 UNC5AQ6ZN44 842 aa20.33■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 KLHL6Q8WZ60 621 aa20.33■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 CD180Q99467 661 aa20.33■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 MAP3K3Q99759 626 aa20.33■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 DDA1Q9BW61 102 aa20.33■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 B3GNT4Q9C0J1 378 aa20.33■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 WHRNQ9P202 907 aa20.33■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 SEMA5BQ9P283 1151 aa20.33■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 ICKQ9UPZ9 632 aa20.33■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa20.33■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 LAMA5O15230 3695 aa20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 TLCD2A6NGC4 264 aa20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 BTN3A3O00478 584 aa20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 BTN3A1O00481 513 aa20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 CHRM3P20309 590 aa20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 ABCG1P45844 678 aa20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 RAB15P59190 212 aa20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 ABRQ12979 859 aa20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 PRKAA1Q13131 559 aa20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 CALCOCO2Q13137 446 aa20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 DUPD1Q68J44 220 aa20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 C19orf48Q6RUI8 117 aa20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 AMIGO1Q86WK6 493 aa20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 ANKMY2Q8IV38 441 aa20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 CFAP61Q8NHU2 1237 aa20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 GSDMBQ8TAX9 411 aa20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 UBXN4Q92575 508 aa20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 CERS2Q96G23 380 aa20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 CTRCQ99895 268 aa20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 GRHL1Q9NZI5 618 aa20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 GALPQ9UBC7 116 aa20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 POLG2Q9UHN1 485 aa20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 POMT2Q9UKY4 750 aa20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 PLAGL1Q9UM63 463 aa20.32■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 GSAPA4D1B5 854 aa20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 E5RI56 91 aa20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 E7ESA3 106 aa20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 KLK10O43240 276 aa20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 KRT37O76014 449 aa20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 TPBGLP0DKB5 382 aa20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 SH3BP2P78314 561 aa20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 TLE3Q04726 772 aa20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 CLN3Q13286 438 aa20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 GBX1Q14549 363 aa20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 DCAF12Q5T6F0 453 aa20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 STEAP4Q687X5 459 aa20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF549Q6P9A3 640 aa20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 CNSTQ6PJW8 725 aa20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 UNC5DQ6UXZ4 953 aa20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 ZFAND4Q86XD8 727 aa20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 ZBTB2Q8N680 514 aa20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 SLC41A2Q96JW4 573 aa20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 PPM1MQ96MI6 270 aa20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC68Q9H2F9 335 aa20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 APMAPQ9HDC9 416 aa20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 FBXO8Q9NRD0 319 aa20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 MATN2O00339 956 aa20.3■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 HAUS5O94927 633 aa20.3■□□□□ 0.84
TMOD3-203ENST00000558455 NELFEP18615 380 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms