RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556170.5

NEK9-209, Transcript of NIMA related kinase 9, humanhuman

TSL 5

Gene NEK9, Length 3,975 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9-209ENST00000556170 AIG1Q9NVV5 245 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 TMCO1Q9UM00 188 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 DMTF1Q9Y222 760 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 hCG_2039718K7EN88 272 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 STX16O14662 325 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 POP4O95707 220 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 SNAP29O95721 258 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 BPIP17213 487 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 MAGEA8P43361 318 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 KIR3DL1P43629 444 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 RPS14P62263 151 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 ERAP2Q6P179 960 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 ADHFE1Q8IWW8 467 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 RGL4Q8IZJ4 473 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 AHI1Q8N157 1196 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 SFRP1Q8N474 314 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 WFDC5Q8TCV5 224 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 ASZ1Q8WWH4 475 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 PEX13Q92968 403 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 ASB1Q9Y576 335 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 GRM6O15303 877 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 RFPL2O75678 378 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 FTH1P02794 183 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 GBAP04062 536 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 GTDC1Q4AE62 458 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 ARSIQ5FYB1 569 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 KANK2Q63ZY3 851 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 RFLNAQ6ZTI6 216 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 TMPRSS11BQ86T26 416 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 PROSER1Q86XN7 944 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 TMEM199Q8N511 208 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 TMIGD2Q96BF3 282 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 RASSF1Q9NS23 344 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 DYRK1BQ9Y463 629 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 C7orf72A4D263 438 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 C5orf58C9J3I9 102 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 SCAMP1O15126 338 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 TRBC1P01850 177 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 PGRP06401 933 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 GNAO1P09471 354 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 WASP42768 502 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 CYP4F3Q08477 520 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 MYLK3Q32MK0 819 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 NXPE1Q8N323 547 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 LZICQ8WZA0 190 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 AP2M1Q96CW1 435 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 CERS4Q9HA82 394 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 SMURF2Q9HAU4 748 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 DNAJC11Q9NVH1 559 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 SCN3BQ9NY72 215 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 WDR81Q562E7 1941 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 TBC1D3BA6NDS4 549 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 HOXC8P31273 242 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 OR4F3Q6IEY1 312 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 GALNT10Q86SR1 603 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 TMBIM1Q969X1 311 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 NSMCE3Q96MG7 304 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 RERGLQ9H628 205 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 CXorf21Q9HAI6 301 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 POPDC3Q9HBV1 291 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 MIEF1Q9NQG6 463 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 MAP10Q9P2G4 905 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 PRSS21Q9Y6M0 314 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 CST5P28325 142 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 PREPP48147 710 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 FAM189BP81408 668 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 CFAP206Q8IYR0 622 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 MARVELD2Q8N4S9 558 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 ZFP28Q8NHY6 868 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 GLMNQ92990 594 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 ZNF382Q96SR6 550 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 MYOCQ99972 504 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 IKZF3Q9UKT9 509 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 CXCR6O00574 342 aa14.53□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 ACOT8O14734 319 aa14.53□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 SERPINA1P01009 418 aa14.53□□□□□ -0.08
NEK9-209ENST00000556170 FGF4P08620 206 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms