RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553301.1

AL845552.2-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AL845552.2, Length 553 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AL845552.2-201ENST00000553301 ZNF185O15231 689 aa20.36■□□□□ 0.85
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AL845552.2-201ENST00000553301 NDC80O14777 642 aa20.32■□□□□ 0.84
AL845552.2-201ENST00000553301 EBLN1P0CF75 366 aa20.32■□□□□ 0.84
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AL845552.2-201ENST00000553301 FOLR1P15328 257 aa20.32■□□□□ 0.84
AL845552.2-201ENST00000553301 ITGB6P18564 788 aa20.32■□□□□ 0.84
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