RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 PCYOX1Q9UHG3 505 aa20.26■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 PLAGL1Q9UM63 463 aa20.26■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 SDR42E2A6NKP2 422 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 NDUFS3O75489 264 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 IVDP26440 423 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 TUBB3Q13509 450 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 PTK6Q13882 451 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 IL11RAQ14626 422 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 PPP1R7Q15435 360 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 ZNF789Q5FWF6 425 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 ARMC3Q5W041 872 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 ARMC6Q6NXE6 501 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 CENPUQ71F23 418 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 TMEM135Q86UB9 458 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 AMIGO1Q86WK6 493 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 KMT5CQ86Y97 462 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 PPIL6Q8IXY8 311 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 TBC1D21Q8IYX1 336 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 NLGN4XQ8N0W4 816 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 OTUD6BQ8N6M0 293 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 IL22RA1Q8N6P7 574 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 OR5K2Q8NHB8 316 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 SIGLEC10Q96LC7 697 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 ULBP3Q9BZM4 244 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 TWSG1Q9GZX9 223 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 GSAPA4D1B5 854 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 SPAG6O75602 509 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 SLCO2B1O94956 709 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 CYP4F2P78329 520 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 HSD11B2P80365 405 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 RHDQ02161 417 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 MRNIPQ6NTE8 343 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 NEPROQ6NW34 567 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 UNC5AQ6ZN44 842 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 LRRC6Q86X45 466 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 SPNS2Q8IVW8 549 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 PITPNM3Q9BZ71 974 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 SPHK1Q9NYA1 384 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 SAMD15Q9P1V8 674 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 GNPTGQ9UJJ9 305 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 BTRCQ9Y297 605 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.835e-8■□□□□ 9.8
CS-222ENST00000550996 F8W8V4 182 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 ERVH48-1M5A8F1 160 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 BANF1O75531 89 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 KIAA0754O94854 1291 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 PRB1P04280 392 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 PVRP15151 417 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 ST6GAL1P15907 406 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 PRKAA1Q13131 559 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 GRB7Q14451 532 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 GPR19Q15760 415 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 TRIM73Q86UV7 250 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 CILP2Q8IUL8 1156 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 CARFQ8N187 725 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 GALNT6Q8NCL4 622 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 ASZ1Q8WWH4 475 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 MENTQ9BUN1 341 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 SLC12A9Q9BXP2 914 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 KLHL25Q9H0H3 589 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 C1GALT1Q9NS00 363 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 FGF21Q9NSA1 209 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 ACTR10Q9NZ32 417 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 GALPQ9UBC7 116 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 ASIC3Q9UHC3 531 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 CIDEBQ9UHD4 219 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 IL17BQ9UHF5 180 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 SAR1BQ9Y6B6 198 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 SPTA1P02549 2419 aa20.22■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 MATN2O00339 956 aa20.22■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 NIPSNAP2O75323 286 aa20.22■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 APOA4P06727 396 aa20.22■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 OGNP20774 298 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 CDH3P22223 829 aa20.22■□□□□ 0.83
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