RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 PAG1Q9NWQ8 432 aa3.48□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC39A1Q9NY26 324 aa3.48□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa3.48□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 JKAMPQ9P055 326 aa3.48□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 TRPS1Q9UHF7 1281 aa3.48□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC24A2Q9UI40 661 aa3.48□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 A4GNTQ9UNA3 340 aa3.48□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 PADI2Q9Y2J8 665 aa3.48□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 DMRT1Q9Y5R6 373 aa3.48□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 RNF215Q9Y6U7 377 aa3.48□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 PARD3Q8TEW0 1356 aa3.48□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 A0A0J9YYE9 177 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 GXYLT2A0PJZ3 443 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 LNP1A1A4G5 178 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 PIPSLA2A3N6 862 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 PRSS29PA6NIE9 313 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 NPIPB13A6NJU9 1138 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 OR52A4PA6NMU1 304 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 MAGEB17A8MXT2 336 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 TCP11X1B4DZS4 312 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 SUPT3HB4E1H0 165 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 NPIPB4C9JG80 1138 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 I3L1I5 382 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF213O14771 459 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 MAGEB2O15479 319 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 VPS4BO75351 444 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 OR5F1O95221 314 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 PGLSO95336 258 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 TGM6O95932 706 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 TRBC1P01850 177 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 HOXB5P09067 269 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 UMPSP11172 480 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 VPREB1P12018 145 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 MMP9P14780 707 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 FUT1P19526 365 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 PTNP21246 168 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 DRD4P21917 467 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 DRD5P21918 477 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 RBL1P28749 1068 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 CD6P30203 668 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 CDC25AP30304 524 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 AXLP30530 894 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 PTPN7P35236 360 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 ME1P48163 572 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 CLK3P49761 638 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 RPS6KA3P51812 740 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF75DP51815 510 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 PRKAG1P54619 331 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 B2MP61769 119 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 TSPAN5P62079 268 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 IRX4P78413 519 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 HHEXQ03014 270 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 HSF2Q03933 536 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 LIPEQ05469 1076 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 CD69Q07108 199 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 CXCL9Q07325 125 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 DPTQ07507 201 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 ACSM1Q08AH1 577 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 PDE7AQ13946 482 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 GPR162Q16538 588 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 RGS21Q2M5E4 152 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF667Q5HYK9 610 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 CEP78Q5JTW2 689 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 HHATQ5VTY9 493 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 TUBA3EQ6PEY2 450 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 NHLRC1Q6VVB1 395 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 HTR3DQ70Z44 454 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 ANO5Q75V66 913 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 VTCN1Q7Z7D3 282 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 STX12Q86Y82 276 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 OR4N4Q8N0Y3 316 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 RNF148Q8N7C7 305 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 STKLD1Q8NE28 680 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 SPATA4Q8NEY3 305 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 OR5AN1Q8NGI8 311 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 OR52B4Q8NGK2 314 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 OR2T3Q8NH03 318 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 SUN3Q8TAQ9 357 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 HEXDCQ8WVB3 486 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.8 ms