RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 ACVR1Q04771 509 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 SEMA3AQ14563 771 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 ALKBH2Q6NS38 261 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 CASC4Q6P4E1 433 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 NLRP9Q7RTR0 991 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 SLC9B2Q86UD5 537 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 CFAP206Q8IYR0 622 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 OR4L1Q8NH43 312 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 HEXDCQ8WVB3 486 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 MFSD3Q96ES6 412 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 IL22Q9GZX6 179 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 CPNE7Q9UBL6 633 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 ASIC3Q9UHC3 531 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 PCYOX1Q9UHG3 505 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 ANAPC5Q9UJX4 755 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 RIMKLBQ9ULI2 386 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 PRSS21Q9Y6M0 314 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 LRBAP50851 2863 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 A0A0G2JNG1 304 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 MGAT4DA6NG13 374 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 PRR19A6NJB7 356 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 SDR42E2A6NKP2 422 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 GOLGA8KD6RF30 607 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 GOLGA8TH3BQL2 631 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 KIR2DS3K7RE56 304 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 TTI1O43156 1089 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 OR1I1O60431 355 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 KCNJ13O60928 360 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 TCEA3O75764 348 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 VAPBO95292 243 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 VIPP01282 170 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 SLC2A4P14672 509 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 MAGEA6P43360 314 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 MAPK9P45984 424 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 GPR3P46089 330 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 FASLGP48023 281 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 DR1Q01658 176 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 DMPKQ09013 629 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 PTK6Q13882 451 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 KIR2DS5Q14953 304 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 BRD3Q15059 726 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 BCL7AQ4VC05 210 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 MANEAQ5SRI9 462 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 METRNLQ641Q3 311 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 AFTPHQ6ULP2 937 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 NAPRTQ6XQN6 538 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 ZNF438Q7Z4V0 828 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 PIM3Q86V86 326 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 TRIM48Q8IWZ4 208 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 PPIL6Q8IXY8 311 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 NAT8LQ8N9F0 302 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 MCUQ8NE86 351 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 OR2L2Q8NH16 312 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 WDR48Q8TAF3 677 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 CXorf40BQ96DE9 158 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 SERPINB12Q96P63 405 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 KRT12Q99456 494 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 NUDT22Q9BRQ3 303 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 TRIM51Q9BSJ1 452 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 CCM2Q9BSQ5 444 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 KIFC1Q9BW19 673 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 TRIM31Q9BZY9 425 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 WWP1Q9H0M0 922 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 SEMA6CQ9H3T2 930 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 EPB41L5Q9HCM4 733 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 TREX1Q9NSU2 369 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 ZNF358Q9NW07 568 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 RNF14Q9UBS8 474 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 SOX13Q9UN79 622 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 ESPNB1AK53 854 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 D6RAR5 112 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 CCDC188H7C350 402 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 PLD2O14939 933 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-217ENST00000550044 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
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