RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 FOXK1P85037 733 aa19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2-204ENST00000548823 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP19.6■□□□□ 0.733e-7■■■■■ 30.7
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CTDSP2-204ENST00000548823 MYLK3Q32MK0 819 aa19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2-204ENST00000548823 LIPMQ5VYY2 423 aa19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2-204ENST00000548823 CRTC1Q6UUV9 634 aa19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2-204ENST00000548823 CAMK1DQ8IU85 385 aa19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2-204ENST00000548823 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa19.6■□□□□ 0.73
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CTDSP2-204ENST00000548823 PKP3Q9Y446 797 aa19.6■□□□□ 0.73
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CTDSP2-204ENST00000548823 TTPAP49638 278 aa19.59■□□□□ 0.73
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CTDSP2-204ENST00000548823 FAM91A1Q658Y4 838 aa19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2-204ENST00000548823 KLC3Q6P597 504 aa19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2-204ENST00000548823 GCNT7Q6ZNI0 430 aa19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2-204ENST00000548823 Q6ZSR6 202 aa19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2-204ENST00000548823 HORMAD1Q86X24 394 aa19.59■□□□□ 0.73
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CTDSP2-204ENST00000548823 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.73
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CTDSP2-204ENST00000548823 TECRLQ5HYJ1 363 aa19.58■□□□□ 0.73
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF549Q6P9A3 640 aa19.58■□□□□ 0.73
CTDSP2-204ENST00000548823 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa19.58■□□□□ 0.73
CTDSP2-204ENST00000548823 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.73
CTDSP2-204ENST00000548823 FBXO39Q8N4B4 442 aa19.58■□□□□ 0.73
CTDSP2-204ENST00000548823 HEXDCQ8WVB3 486 aa19.58■□□□□ 0.73
CTDSP2-204ENST00000548823 LPGAT1Q92604 370 aa19.58■□□□□ 0.73
CTDSP2-204ENST00000548823 VOPP1Q96AW1 172 aa19.58■□□□□ 0.73
CTDSP2-204ENST00000548823 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
CTDSP2-204ENST00000548823 SORT1Q99523 831 aa19.58■□□□□ 0.73
CTDSP2-204ENST00000548823 NDNQ99608 321 aa19.58■□□□□ 0.73
CTDSP2-204ENST00000548823 GPR63Q9BZJ6 419 aa19.58■□□□□ 0.73
CTDSP2-204ENST00000548823 ADNPQ9H2P0 1102 aa19.58■□□□□ 0.73
CTDSP2-204ENST00000548823 SAR1AQ9NR31 198 aa19.58■□□□□ 0.73
CTDSP2-204ENST00000548823 GPR27Q9NS67 375 aa19.58■□□□□ 0.73
CTDSP2-204ENST00000548823 DCTN4Q9UJW0 460 aa19.58■□□□□ 0.73
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC189A1A4V9 331 aa19.57■□□□□ 0.72
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CTDSP2-204ENST00000548823 MC4RP32245 332 aa19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-204ENST00000548823 UGT1A5P35504 534 aa19.57■□□□□ 0.72
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CTDSP2-204ENST00000548823 RPIAP49247 311 aa19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-204ENST00000548823 CDKN2DP55273 166 aa19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-204ENST00000548823 XIAPP98170 497 aa19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-204ENST00000548823 CACNG1Q06432 222 aa19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-204ENST00000548823 PEX6Q13608 980 aa19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-204ENST00000548823 FZD2Q14332 565 aa19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-204ENST00000548823 SPRED3Q2MJR0 410 aa19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-204ENST00000548823 MANEAQ5SRI9 462 aa19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-204ENST00000548823 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-204ENST00000548823 CERS6Q6ZMG9 384 aa19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-204ENST00000548823 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-204ENST00000548823 STON2Q8WXE9 905 aa19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-204ENST00000548823 NAT6Q93015 286 aa19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-204ENST00000548823 WWP1Q9H0M0 922 aa19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-204ENST00000548823 SYTL2Q9HCH5 934 aa19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-204ENST00000548823 XPR1Q9UBH6 696 aa19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-204ENST00000548823 FKBPLQ9UIM3 349 aa19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-204ENST00000548823 HAO1Q9UJM8 370 aa19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-204ENST00000548823 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa19.57■□□□□ 0.72
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