RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516663.1

RNU6-521P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 521, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-521P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-521P-201ENST00000516663 CEACAM4O75871 244 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 KCNK5O95279 499 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 SEC24AO95486 1093 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 S100BP04271 92 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 FAM200BP0CF97 657 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 ACP2P11117 423 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 TNFAIP3P21580 790 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 MDKP21741 143 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 CHRNA3P32297 505 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 ADD2P35612 726 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 PRCPP42785 496 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 KHKP50053 298 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 PRELPP51888 382 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 MECOMQ03112 1051 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 PRKAA1Q13131 559 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 FGFBP1Q14512 234 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 ANKRD1Q15327 319 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 SPECC1Q5M775 1068 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 LINC00242Q5T6M2 205 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 MARC1Q5VT66 337 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 LCLAT1Q6UWP7 414 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 RNF130Q86XS8 419 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 ZNF547Q8IVP9 402 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 OR14L1PQ8NHC6 308 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 GATAD1Q8WUU5 269 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 JDP2Q8WYK2 163 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 STAMQ92783 540 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 APOL2Q9BQE5 337 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 OVOL2Q9BRP0 275 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 HOXD1Q9GZZ0 328 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 CPVLQ9H3G5 476 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 RASSF1Q9NS23 344 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 HCN3Q9P1Z3 774 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 ZNF319Q9P2F9 582 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 COPG2Q9UBF2 871 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 KLK12Q9UKR0 248 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 ITGB4P16144 1822 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 E9PAM4 449 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 E9PI62 339 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 K7ENM7 598 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 TSPAN3O60637 253 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 PRDM1O75626 825 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 GJB3O75712 270 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 CNPP09543 421 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 PTPN3P26045 913 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 PSMC4P43686 418 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 RPL34P49207 117 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 KRTAP12-3P60328 96 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 CSNK2BP67870 215 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 GAGE2BQ13066 116 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 EBI3Q14213 229 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 TIGD6Q17RP2 521 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 COL28A1Q2UY09 1125 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 GAGE2EQ4V326 116 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 TFDP3Q5H9I0 405 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 GAGE2AQ6NT46 116 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 TMEM207Q6UWW9 146 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 ZNF534Q76KX8 674 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 LRP11Q86VZ4 500 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 C4orf32Q8N8J7 132 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 RNF138Q8WVD3 245 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 ELP4Q96EB1 424 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 TMEM68Q96MH6 324 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 HES7Q9BYE0 225 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 A4GALTQ9NPC4 353 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 ASAH2Q9NR71 780 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 GAGE2DQ9UEU5 116 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 PTCH1Q13635 1447 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 ELOVL7A1L3X0 281 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 GAGE10A6NGK3 116 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 LRRC53A6NM62 1247 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 J3QR06 171 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 ATP2A1O14983 1001 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 EPHB6O15197 1021 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 PLPP2O43688 288 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 GLRA3O75311 464 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 GUCY1B2O75343 617 aa0.39□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms