RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 PSMD7P51665 324 aa26.54■■□□□ 1.84
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SH3BP2-221ENST00000511747 RUNDC3AQ59EK9 446 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BP2-221ENST00000511747 ADGRF1Q5T601 910 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BP2-221ENST00000511747 FUT10Q6P4F1 479 aa26.54■■□□□ 1.84
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SH3BP2-221ENST00000511747 PHACTR4Q8IZ21 702 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BP2-221ENST00000511747 CARNMT1Q8N4J0 409 aa26.54■■□□□ 1.84
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SH3BP2-221ENST00000511747 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa26.52■■□□□ 1.84
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SH3BP2-221ENST00000511747 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
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SH3BP2-221ENST00000511747 PRSS21Q9Y6M0 314 aa26.52■■□□□ 1.84
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SH3BP2-221ENST00000511747 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.84
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SH3BP2-221ENST00000511747 LOC730098B7Z3J9 87 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 PTGES3LE9PB15 166 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 E2F6O75461 281 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 RETP07949 1114 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 GABARAPL2P60520 117 aa26.5■■□□□ 1.83
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SH3BP2-221ENST00000511747 GPR149Q86SP6 731 aa26.5■■□□□ 1.83
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