RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 VAPBO95292 243 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 CRTAMO95727 393 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 NDST3O95803 873 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 CD160O95971 181 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 AHSGP02765 367 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 FGF1P05230 155 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 EPHX1P07099 455 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 FESP07332 822 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 SBK3P0C264 359 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 UQCRBP14927 111 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 RAC2P15153 192 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 GABRB3P28472 473 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADRA1AP35348 466 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 OPRD1P41143 372 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 GLRBP48167 497 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 NUDT2P50583 147 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 CLCN5P51795 746 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 NAGLUP54802 743 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 DNAJB13P59910 316 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 RPS26P62854 115 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 SATB1Q01826 763 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 POU4F1Q01851 419 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 TFF2Q03403 129 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 MED21Q13503 144 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 STARD3Q14849 445 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 POU6F1Q14863 301 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 PON2Q15165 354 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 MAPRE2Q15555 327 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRIP10Q15642 601 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC14A2Q15849 920 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 FBXO43Q4G163 708 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 SIRPB2Q5JXA9 342 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 DGKKQ5KSL6 1271 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 SH2D4BQ5SQS7 431 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM46CQ5VWP2 391 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 LPCAT4Q643R3 524 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 NXNQ6DKJ4 435 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 DENND5AQ6IQ26 1287 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZFP1Q6P2D0 407 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 C22orf39Q6P5X5 142 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 RANBP10Q6VN20 620 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 GDPD4Q6W3E5 623 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF852Q6ZMS4 543 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 KIAA0408Q6ZU52 694 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 KBTBD6Q86V97 674 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 CAMK1DQ8IU85 385 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADHFE1Q8IWW8 467 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 LSMEM2Q8N112 164 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCNYL1Q8N7R7 359 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 DTWD2Q8NBA8 298 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 KYQ8NBH2 561 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 CATSPER1Q8NEC5 780 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 LPCAT1Q8NF37 534 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARRDC2Q8TBH0 407 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 AGR3Q8TD06 166 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 CALML6Q8TD86 181 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 SORCS1Q8WY21 1168 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR8D1Q8WZ84 308 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM3CQ92520 227 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 NXNL1Q96CM4 212 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC126Q96EE4 140 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHFRQ96EP1 664 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 PPP1R16AQ96I34 528 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 LRIG1Q96JA1 1093 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 LMLNQ96KR4 655 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 CATSPER2Q96P56 530 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 BTBD9Q96Q07 612 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 NELL2Q99435 816 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 NUF2Q9BZD4 464 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM192AQ9GZU8 254 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 EFCAB1Q9HAE3 211 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARNT2Q9HBZ2 717 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 HEBP1Q9NRV9 189 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 MRGBPQ9NV56 204 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 HACD3Q9P035 362 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 THEGQ9P2T0 379 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms