RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493945.5

ACTB-213, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,236 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-213ENST00000493945 GULP1Q9UBP9 304 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 FTSJ1Q9UET6 329 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 CDYLQ9Y232 598 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 FAM221BA6H8Z2 402 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 A6NCN8 305 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 GFRA3O60609 400 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 MATN4O95460 622 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 PYGBP11216 843 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 GLB1P16278 677 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 KRT4P19013 534 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 TAC1P20366 129 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 SDHBP21912 280 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 PDHA2P29803 388 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 ABRQ12979 859 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 SHBQ15464 509 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 CCDC153Q494R4 210 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 OGFOD3Q6PK18 319 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 TRABD2AQ86V40 505 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 NAXDQ8IW45 347 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 NAGSQ8N159 534 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 TCAIMQ8N3R3 496 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 SLC25A45Q8N413 288 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 EID2Q8N6I1 236 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 RHEBL1Q8TAI7 183 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 NETO1Q8TDF5 533 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 RHBDD1Q8TEB9 315 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 SLC37A2Q8TED4 501 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 APOPT1Q96IL0 206 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 UBXN10Q96LJ8 280 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 SLC38A3Q99624 504 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 UCK1Q9HA47 277 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 PARVBQ9HBI1 364 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 MKS1Q9NXB0 559 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 SPATA7Q9P0W8 599 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 GRID1Q9ULK0 1009 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 RNF112Q9ULX5 631 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 WDFY4Q6ZS81 3184 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 HMX2A2RU54 273 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 MATN2O00339 956 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 MAP2K7O14733 419 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 RFPL1O75677 317 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 SYF2O95926 243 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 ANXA5P08758 320 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 CD1DP15813 335 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 TFEBP19484 476 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 ACADLP28330 430 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 SHMT2P34897 504 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 EPHA4P54764 986 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 PRKAA1Q13131 559 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 CDKL4Q5MAI5 379 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 KYQ8NBH2 561 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 GPR156Q8NFN8 814 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 ASB11Q8WXH4 323 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 KIAA1191Q96A73 305 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 SLC30A3Q99726 388 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 EGFL8Q99944 293 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 HGH1Q9BTY7 390 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 SLC12A9Q9BXP2 914 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 TMBIM4Q9HC24 238 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 PARD6AQ9NPB6 346 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 MED4Q9NPJ6 270 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 LILRA5A6NI73 299 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 OR52A4PA6NMU1 304 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 C4orf47A7E2U8 309 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 KERAO60938 352 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 SMIM24O75264 130 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 C1orf105O95561 183 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 BRAFP15056 766 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 PNLIPP16233 465 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 CCND1P24385 295 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 GPR3P46089 330 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 HNMTP50135 292 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 CDKL1Q00532 357 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 ASPHQ12797 758 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 ARHGAP19Q14CB8 494 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-213ENST00000493945 CLCA4Q14CN2 919 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms