RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492423.5

COPS7B-222, Transcript of COP9 signalosome subunit 7B, human

TSL 2

Gene COPS7B, Length 689 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS7B-222	ENST00000492423	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		14.54	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		14.54	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	PARVB	Q9HBI1	364 aa		14.54	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		14.54	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		14.54	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		14.54	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		14.54	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	TAPBP	O15533	448 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	NPHS1	O60500	1241 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	VCL	P18206	1134 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	IMPDH1	P20839	514 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	CYP2A7	P20853	494 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	SLC1A6	P48664	564 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	AGTR2	P50052	363 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	CLCNKA	P51800	687 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	HERVK_113	P63132	956 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	RCN2	Q14257	317 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	PMS2CL	Q68D20	193 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	IQCH	Q86VS3	1027 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	HID1	Q8IV36	788 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	LSMEM2	Q8N112	164 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	C7orf26	Q96N11	449 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	DRC3	Q9H069	523 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	WWP1	Q9H0M0	922 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	KLF15	Q9UIH9	416 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	ASB1	Q9Y576	335 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS7B-222	ENST00000492423	SNX2	O60749	519 aa		14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	RASGRP1	O95267	797 aa		14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	C1orf105	O95561	183 aa		14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	GUCA1C	O95843	209 aa		14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	CHRNG	P07510	517 aa		14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	MAPK9	P45984	424 aa		14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	RPIA	P49247	311 aa		14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	CTBS	Q01459	385 aa		14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	ESAM	Q96AP7	390 aa		14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	FOPNL	Q96NB1	174 aa		14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	EGFL8	Q99944	293 aa		14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	THAP1	Q9NVV9	213 aa		14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		14.52	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	PRR33	A8MZF0	331 aa		14.51	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	TNF	P01375	233 aa		14.51	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	ANXA5	P08758	320 aa		14.51	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	AVPR2	P30518	371 aa		14.51	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	AP1S2	P56377	157 aa		14.51	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	OVGP1	Q12889	678 aa		14.51	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	LRP8	Q14114	963 aa		14.51	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	14.51	□□□□□ -0.09	1e-6	■■■■□ 20.9
COPS7B-222	ENST00000492423	TERF2	Q15554	542 aa		14.51	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		14.51	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	C11orf74	Q86VG3	221 aa		14.51	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	PARG	Q86W56	976 aa		14.51	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	NRROS	Q86YC3	692 aa		14.51	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		14.51	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		14.51	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	FBXL8	Q96CD0	374 aa		14.51	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		14.51	□□□□□ -0.09
COPS7B-222	ENST00000492423	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09

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