RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491954.5

CIZ1-223, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 3

Gene CIZ1, Length 955 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-223	ENST00000491954	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	PREB	Q9HCU5	417 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	PLXNA2	O75051	1894 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	BTN3A1	O00481	513 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	INPP4B	O15327	924 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	VEGFD	O43915	354 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	TSPAN12	O95859	305 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	IMPDH1	P20839	514 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	AOAH	P28039	575 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	KCNC1	P48547	511 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	CCT8	P50990	548 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	NAGLU	P54802	743 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	BNC1	Q01954	994 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	OCRL	Q01968	901 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	DET1	Q7L5Y6	550 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	FAM124A	Q86V42	546 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	HORMAD1	Q86X24	394 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	ASB12	Q8WXK4	309 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	NXPE2	Q96DL1	559 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	GPR34	Q9UPC5	381 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954		A0A1W2PQU0	124 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954		A8MT66	165 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	CDC7	O00311	574 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	RAD51B	O15315	384 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	SNX2	O60749	519 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	MTX2	O75431	263 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	IGLV3-19	P01714	112 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	MPC1L	P0DKB6	136 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	GFAP	P14136	432 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	CCR7	P32248	378 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	MAPK9	P45984	424 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	HK2	P52789	917 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	ADPRH	P54922	357 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	NFKB2	Q00653	900 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	OR4D1	Q15615	310 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	KIF19	Q2TAC6	998 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	DHRS13	Q6UX07	377 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF605	Q86T29	641 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	GPSM1	Q86YR5	675 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	ELMO1	Q92556	727 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	PHF21B	Q96EK2	531 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	LRRC72	A6NJI9	287 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	OR2AG2	A6NM03	316 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	STX16	O14662	325 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC16A5	O15375	505 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	ITM2A	O43736	263 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	KLK8	O60259	260 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	NUAK1	O60285	661 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CIZ1-223	ENST00000491954	PCDHGA12	O60330	932 aa		12.05	□□□□□ -0.48

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms