RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 CAMKMTQ7Z624 323 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 IQCHQ86VS3 1027 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 GBGT1Q8N5D6 347 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 TC2NQ8N9U0 490 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 CFAP61Q8NHU2 1237 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 SMPDL3BQ92485 455 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 TAF4BQ92750 862 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 PTP4A1Q93096 173 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 OR6C1Q96RD1 312 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 SLC25A23Q9BV35 468 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 NUP85Q9BW27 656 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 EPS15L1Q9UBC2 864 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 IL17BQ9UHF5 180 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 LRRD1A4D1F6 860 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 TSPAN1O60635 241 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 LDLRP01130 860 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 PENKP01210 267 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 CCKARP32238 428 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 MC5RP33032 325 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 AHRP35869 848 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 CDH13P55290 713 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 RALGDSQ12967 914 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 CBX3Q13185 183 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 ZNF585BQ52M93 769 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 ARMC4Q5T2S8 1044 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 MPP7Q5T2T1 576 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 FIGLAQ6QHK4 219 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 SUSD1Q6UWL2 747 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 KLHL7Q8IXQ5 586 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 CAMKVQ8NCB2 501 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 EXD1Q8NHP7 514 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 SECTM1Q8WVN6 248 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 TEKT4Q8WW24 435 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 SORCS1Q8WY21 1168 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 ARSGQ96EG1 525 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 FAM81BQ96LP2 452 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 AK8Q96MA6 479 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 MS4A10Q96PG2 267 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 MGME1Q9BQP7 344 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 FAM129AQ9BZQ8 928 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 THAP9Q9H5L6 903 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 HAO2Q9NYQ3 351 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 CACNG4Q9UBN1 327 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 DENND3A2RUS2 1198 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 ASPDHA6ND91 283 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 TULP2O00295 520 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 PSMD14O00487 310 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 ZBTB14O43829 449 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 GPR137BO60478 399 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 HMMRO75330 724 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 MED24O75448 989 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 PNPP00491 289 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 PFKFB1P16118 471 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 HOXC8P31273 242 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 GABRA5P31644 462 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 PRKCIP41743 596 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 FUT6P51993 359 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 PLA2G7Q13093 441 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 HYAL4Q2M3T9 481 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 GLRA4Q5JXX5 417 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 C6orf163Q5TEZ5 329 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 KRT39Q6A163 491 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 FAM171BQ6P995 826 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 SPSB3Q6PJ21 355 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 OTOAQ7RTW8 1153 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 SPATA21Q7Z572 469 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 HOOK3Q86VS8 718 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 NAGSQ8N159 534 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 ZNF619Q8N2I2 560 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 LMO3Q8TAP4 145 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 MTERF3Q96E29 417 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 ABHD8Q96I13 439 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 RUNDC3BQ96NL0 473 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 C16orf70Q9BSU1 422 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 PI4K2AQ9BTU6 479 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 GPR88Q9GZN0 384 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 SLA2Q9H6Q3 261 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 EVA1AQ9H8M9 152 aa4.74□□□□□ -1.65
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