RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488923.1

HDLBP-243, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-243ENST00000488923 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 ACSS2Q9NR19 701 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 ASIC5Q9NY37 505 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 GALPQ9UBC7 116 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 IL36AQ9UHA7 158 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 SCOCQ9UIL1 159 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 CLEC4EQ9ULY5 219 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 SNX6Q9UNH7 406 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 ANKRD36A6QL64 1941 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 SERTM1A2A2V5 107 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 LINC01553A4QN01 128 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 IQCF5A8MTL0 148 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 H3BNX3 289 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 ARNTLO00327 626 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 FBP2O00757 339 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 PER2O15055 1255 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 BNIP3LO60238 219 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 UGDHO60701 494 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 EEDO75530 441 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 RFPL2O75678 378 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 CLDN9O95484 217 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 GPIP06744 558 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 CAPN1P07384 714 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 C1SP09871 688 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 UMPSP11172 480 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 FCGR1AP12314 374 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 UGT1A6P19224 532 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 UGT1A1P22309 533 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 UGT1A4P22310 534 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 JAK1P23458 1154 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 AOAHP28039 575 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 SLC7A1P30825 629 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 AKT1P31749 480 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 GKP32189 559 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 UGT1A3P35503 534 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 UGT1A5P35504 534 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 GATA4P43694 442 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 AGTR2P50052 363 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 HK3P52790 923 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 ERVPABLB-1P60509 514 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 MED21Q13503 144 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 NFYCQ13952 458 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 ADGRE1Q14246 886 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 INPP5AQ14642 412 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 DHCR24Q15392 516 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 TRIP10Q15642 601 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 IMPG1Q17R60 797 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 C6orf136Q5SQH8 315 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 PAOXQ6QHF9 649 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 IL27RAQ6UWB1 636 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 DPPA4Q7L190 304 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 TSPAN33Q86UF1 283 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 NLRP8Q86W28 1048 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 PDSS2Q86YH6 399 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 FUNDC1Q8IVP5 155 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 DPP10Q8N608 796 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 CLDN19Q8N6F1 224 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 PNPLA1Q8N8W4 532 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 FNDC5Q8NAU1 212 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 OR4F6Q8NGB9 312 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 GDPD5Q8WTR4 605 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 FRS2Q8WU20 508 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 UCMAQ8WVF2 138 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 NRG4Q8WWG1 115 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 STARD8Q92502 1023 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 GLMNQ92990 594 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 TCEAL4Q96EI5 215 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 BOCQ9BWV1 1114 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms