RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 CPNE9Q8IYJ1 553 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 BANPQ8N9N5 519 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 OR2I1PQ8NGU4 316 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 GIMAP7Q8NHV1 300 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 STAG3L4Q8TBR4 150 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 RDH11Q8TC12 318 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 KIAA1191Q96A73 305 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 LINGO1Q96FE5 620 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TRIM54Q9BYV2 358 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TMEM168Q9H0V1 697 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 OR52A5Q9H2C5 316 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 RDH14Q9HBH5 336 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PCMTD2Q9NV79 361 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 GALPQ9UBC7 116 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 GULP1Q9UBP9 304 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 SLC23A2Q9UGH3 650 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 POLG2Q9UHN1 485 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 CEP192Q8TEP8 1941 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 GON4LQ3T8J9 2241 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 A0A1B0GTQ1 180 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 LMO7DNF2Z398 122 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 GFYI3L273 518 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 AQP9O43315 295 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ZBTB14O43829 449 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TYROBPO43914 113 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PIAS2O75928 621 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ZWINTO95229 277 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 CATP04040 527 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 BRAFP15056 766 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 CD1DP15813 335 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 CYP2A7P20853 494 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ACTR1BP42025 376 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PI4KAP42356 2102 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 AP1S2P56377 157 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ACTR1AP61163 376 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 CDKL1Q00532 357 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 GRIK2Q13002 908 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 CSHL1Q14406 222 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 NFE2L1Q14494 772 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ACSBG2Q5FVE4 666 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PRRT3Q5FWE3 981 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TMEM207Q6UWW9 146 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TAF8Q7Z7C8 310 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 RASGRP3Q8IV61 690 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 MINDY1Q8N5J2 469 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 MCOLN3Q8TDD5 553 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ASB11Q8WXH4 323 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ARL8AQ96BM9 186 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 SLC30A3Q99726 388 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 LRRC61Q9BV99 259 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 DUSP23Q9BVJ7 150 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 SLC12A9Q9BXP2 914 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 MVB12BQ9H7P6 319 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 DOLKQ9UPQ8 538 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PRKAB1Q9Y478 270 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 SNX11Q9Y5W9 270 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ANXA6P08133 673 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ALPPL2P10696 532 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 F3P13726 295 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TFEBP19484 476 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TAC1P20366 129 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 HIST1H2ADP20671 130 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ACADLP28330 430 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 HSD17B2P37059 387 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 CCT8P50990 548 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 NAA20P61599 178 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 BNC1Q01954 994 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ZNF460Q14592 562 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TTMPQ5BVD1 217 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 NRROSQ86YC3 692 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TBC1D21Q8IYX1 336 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 C4orf33Q8N1A6 199 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 KCTD4Q8WVF5 259 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ANKRD49Q8WVL7 239 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 FAM136AQ96C01 138 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 NXNL1Q96CM4 212 aa11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms