RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 DYDC1Q8WWB3 177 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 GIMAP1Q8WWP7 306 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF653Q96CK0 615 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 CDHR1Q96JP9 859 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 HARBI1Q96MB7 349 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 DUX3Q96PT4 197 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 PLEKHF1Q96S99 279 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 NDNQ99608 321 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM47Q9BQJ4 181 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 SDF4Q9BRK5 362 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 SCRT2Q9NQ03 307 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 PANK4Q9NVE7 773 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM118AQ9NWS6 357 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 RHBDL2Q9NX52 303 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 HOXC10Q9NYD6 342 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 UBAP1Q9NZ09 502 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 CFAP45Q9UL16 551 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 GAB2Q9UQC2 676 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 TMED5Q9Y3A6 229 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 OR2W1Q9Y3N9 320 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 TAF1P21675 1872 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 CROCC2H7BZ55 1655 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 IQGAP2Q13576 1575 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 NSD3Q9BZ95 1437 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 GMNCA6NCL1 334 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 CCT8L1PA6NM43 557 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 H3BQV1 296 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 TAF4O00268 1085 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 SPINT2O43291 252 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 SUPT3HO75486 399 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC159P0C7I6 412 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC166P0CW27 439 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 KRT10P13645 584 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 NQO1P15559 274 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 ABCD3P28288 659 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 HOXD10P28358 340 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 GLIPR1P48060 266 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 CCNG1P51959 295 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 MYL5Q02045 173 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 GTF2H2Q13888 395 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 MTF1Q14872 753 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 CMPK2Q5EBM0 449 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 HYIQ5T013 277 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 STXBP5Q5T5C0 1151 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 CFAP58Q5T655 872 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 FRG2Q64ET8 278 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 KCTD16Q68DU8 428 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 RAD9BQ6WBX8 426 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF852Q6ZMS4 543 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 MAATS1Q7Z4T9 603 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 EPHX4Q8IUS5 362 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 ARHGAP18Q8N392 663 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 NFKBIDQ8NI38 313 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 PIGTQ969N2 578 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 PPP1R14BQ96C90 147 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 GRAMD2BQ96HH9 432 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 C8orf76Q96K31 380 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 ZIM3Q96PE6 472 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 PANX2Q96RD6 677 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 SYT15Q9BQS2 421 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 PCGF1Q9BSM1 259 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 CARD9Q9H257 536 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 VCXQ9H320 206 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC28A3Q9HAS3 691 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 POLD4Q9HCU8 107 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 CIDEBQ9UHD4 219 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 HAO1Q9UJM8 370 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 RABL2BQ9UNT1 228 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 ITM2BQ9Y287 266 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 SH3GLB1Q9Y371 365 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 ABCC3O15438 1527 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 EFCAB6Q5THR3 1501 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-210ENST00000485459 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms