RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHRNA6Q15825 494 aa16.31■□□□□ 0.2
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DLG1Q12959 904 aa16.31■□□□□ 0.2
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POMZP3Q6PJE2 187 aa16.31■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa16.31■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LEMD2Q8NC56 503 aa16.31■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZMIZ2Q8NF64 920 aa16.31■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HIST1H2ACQ93077 130 aa16.31■□□□□ 0.2
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SCELO95171 688 aa16.3■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IDSP22304 550 aa16.3■□□□□ 0.2
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC26A3P40879 764 aa16.3■□□□□ 0.2
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MS4A13Q5J8X5 152 aa16.3■□□□□ 0.2
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC58Q96CX6 371 aa16.3■□□□□ 0.2
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa16.3■□□□□ 0.2
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GINS4Q9BRT9 223 aa16.3■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC3Q9BY71 257 aa16.3■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCNFP41002 786 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GATMP50440 423 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF730Q6ZMV8 503 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SUV39H2Q9H5I1 410 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDE10AQ9Y233 779 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NFATC1O95644 943 aa16.29■□□□□ 0.2
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GKP32189 559 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBXN11Q5T124 520 aa16.29■□□□□ 0.2
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCTD8Q6ZWB6 473 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACDQ96AP0 544 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC22A14Q9Y267 594 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LAMA4Q16363 1823 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAST2Q6P0Q8 1798 aa16.29■□□□□ 0.2
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDH3P22223 829 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC7A1P30825 629 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GHRHRQ02643 423 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDH1Q08174 1060 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC2A7Q6PXP3 512 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAR1Q8WVX9 515 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYO7AQ13402 2215 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ILVBLA1L0T0 632 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HAS3O00219 553 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HAT1O14929 419 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CASKO14936 926 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TGFB1P01137 390 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AOC1P19801 751 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
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