RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	RAB33B	Q9H082	229 aa		14.39	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	14.39	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	14.39	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	14.39	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		14.39	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	RARRES3	Q9UL19	164 aa		14.39	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		14.39	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		14.39	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880		E5RI56	91 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	BTN3A3	O00478	584 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	KDM1A	O60341	852 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	LIF	P15018	202 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	FOLR1	P15328	257 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF28	P17035	718 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	CYP4F2	P78329	520 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	HSD11B2	P80365	405 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	GPR19	Q15760	415 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	PCSK4	Q6UW60	755 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	DTX1	Q86Y01	620 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	CARD6	Q9BX69	1037 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	POLG2	Q9UHN1	485 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	14.38	□□□□□ -0.11	6e-9	■□□□□ 9.1
SSR4-208	ENST00000471880	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	MAGEB16	A2A368	324 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	PIPSL	A2A3N6	862 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	C2orf74	A8MZ97	194 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	MATN2	O00339	956 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	RPN2	P04844	631 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	MLN	P12872	115 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	CHRM3	P20309	590 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	SHMT2	P34897	504 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	MAGEA6	P43360	314 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	DR1	Q01658	176 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	RHD	Q02161	417 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	ACY1	Q03154	408 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	IL11RA	Q14626	422 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	NEPRO	Q6NW34	567 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	TTC23L	Q6PF05	361 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC6	Q86X45	466 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	VRK3	Q8IV63	474 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	MCU	Q8NE86	351 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	SGSM3	Q96HU1	749 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	FANCE	Q9HB96	536 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	FGF21	Q9NSA1	209 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	POMT2	Q9UKY4	750 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	ICK	Q9UPZ9	632 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		14.36	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	ISM1	B1AKI9	464 aa		14.36	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	14.36	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	KPNA5	O15131	536 aa		14.36	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	NIPSNAP2	O75323	286 aa		14.36	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	SPAG6	O75602	509 aa		14.36	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		14.36	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	PRKAR1A	P10644	381 aa		14.36	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	PVR	P15151	417 aa		14.36	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	14.36	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	ARNT	P27540	789 aa		14.36	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	14.36	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	PTK6	Q13882	451 aa		14.36	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	BBS9	Q3SYG4	887 aa		14.36	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	CNST	Q6PJW8	725 aa		14.36	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	14.36	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	14.36	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	PCGF5	Q86SE9	256 aa		14.36	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM73	Q86UV7	250 aa		14.36	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	KMT5C	Q86Y97	462 aa		14.36	□□□□□ -0.11
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		14.36	□□□□□ -0.11

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