RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468915.5

SLC13A3-209, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SLC13A3, Length 1,597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-209ENST00000468915 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 BTN3A1O00481 513 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 PCDHGA12O60330 932 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 C1orf105O95561 183 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 CER1O95813 267 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 GSTA1P08263 222 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 SLC35G4P0C7Q5 338 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 ETV4P43268 484 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 CCT8P50990 548 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 ATP6V0D1P61421 351 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 CSRP2Q16527 193 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 GKN2Q86XP6 184 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 MYO1HQ8N1T3 1032 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 GPR156Q8NFN8 814 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 OR5AR1Q8NGP9 310 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 SLC37A2Q8TED4 501 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 DENND1AQ8TEH3 1009 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 C12orf66Q96MD2 445 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 SLC12A9Q9BXP2 914 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 ALG9Q9H6U8 611 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 NMRAL1Q9HBL8 299 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 SLC17A7Q9P2U7 560 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 PLLPQ9Y342 182 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 U3KQA8 63 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 GOLGA6L10A6NI86 522 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 TK2O00142 265 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 PLIN3O60664 434 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 LRP3O75074 770 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 GLRA3O75311 464 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 PROCP04070 461 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 ZNF883P0CG24 379 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 BDKRB1P46663 353 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 NHLH1Q02575 133 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 ACAP2Q15057 778 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 FAM83EQ2M2I3 478 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 UNC5DQ6UXZ4 953 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 ASCL5Q7RTU5 278 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 LCA5Q86VQ0 697 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 CFAP61Q8NHU2 1237 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 RHEBL1Q8TAI7 183 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 TCP10LQ8TDR4 215 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 SMC6Q96SB8 1091 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 FAM53CQ9NYF3 392 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 XPR1Q9UBH6 696 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 DCDC2Q9UHG0 476 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 ASXL3Q9C0F0 2248 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 B4DGG1 531 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 COPEO14579 308 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 YKT6O15498 198 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 FFAR2O15552 330 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 MAZP56270 477 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 SLC35F3Q8IY50 421 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 ARL14Q8N4G2 192 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 KYQ8NBH2 561 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 OR4C6Q8NH72 309 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 OR5K2Q8NHB8 316 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 TWSG1Q9GZX9 223 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 CIDEBQ9UHD4 219 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 BTBD3Q9Y2F9 522 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 NEMP2A6NFY4 417 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 G3V2L1 256 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 SLC16A5O15375 505 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 KLK8O60259 260 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 KERAO60938 352 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 C8GP07360 202 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 ANXA6P08133 673 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 DHRS4L1P0CG22 281 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 MYF5P13349 255 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 CCT5P48643 541 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 WDR4P57081 412 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 SP140Q13342 867 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 TGFBIQ15582 683 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 ACBD3Q9H3P7 528 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 RDH14Q9HBH5 336 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms