RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 HEATR9A2RTY3 570 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 DRGXA6NNA5 263 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PRAMEF11O60813 436 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 NR4A1P22736 598 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PSMB4P28070 264 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 VIPR1P32241 457 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 GRIA3P42263 894 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CDK18Q07002 472 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ST3GAL2Q16842 350 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 TMTC4Q5T4D3 741 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 OR52E8Q6IFG1 317 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 LSMEM2Q8N112 164 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PARP8Q8N3A8 854 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 UBR7Q8N806 425 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF781Q8N8C0 355 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ARL10Q8N8L6 244 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CDC26Q8NHZ8 85 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 YIPF2Q9BWQ6 316 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 THSD1Q9NS62 852 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 SELENONQ9NZV5 590 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM216Q9P0N5 145 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 TRHDEQ9UKU6 1024 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PADI4Q9UM07 663 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ORC6Q9Y5N6 252 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 RGSL1A5PLK6 1076 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 FAM149AA5PLN7 773 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 VILLO15195 856 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 UBDO15205 165 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 TIPRLO75663 272 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ALBP02768 609 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 FYNP06241 537 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CKMT2P17540 419 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 IDH3AP50213 366 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CDH15P55291 814 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 YPEL5P62699 121 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ADRM1Q16186 407 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM198Q66K66 360 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PACS1Q6VY07 963 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 FRMD7Q6ZUT3 714 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 USP53Q70EK8 1073 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 DSELQ8IZU8 1212 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PHC3Q8NDX5 983 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 WDR48Q8TAF3 677 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 RIN3Q8TB24 985 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CMKLR1Q99788 373 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 LRRC40Q9H9A6 602 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 EGFL7Q9UHF1 273 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF180Q9UJW8 692 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 C9JVG2 144 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 E5RI56 91 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 M0R3G1 203 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 FTH1P19P0C7X4 201 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PIRTP0C851 137 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 C6P13671 934 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CNTFP26441 200 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 HMOX2P30519 316 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 HCAR3P49019 387 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 RPL14P50914 215 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 SLC10A7Q0GE19 358 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PTP4A2Q12974 167 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CBX3Q13185 183 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 LDLRAP1Q5SW96 308 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ZFP1Q6P2D0 407 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF554Q86TJ5 538 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ADCK1Q86TW2 530 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 HEATR4Q86WZ0 1026 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 SLC35B2Q8TB61 432 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 TUBGCP3Q96CW5 907 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 FICDQ9BVA6 458 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 SCNM1Q9BWG6 230 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 SNX15Q9NRS6 342 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 B4GALT6Q9UBX8 382 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 DAPK2Q9UIK4 370 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ACOT9Q9Y305 439 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 APC2O95996 2303 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PTGES3LE9PB15 166 aa5.88□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 MRASO14807 208 aa5.88□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 MAGEB3O15480 346 aa5.88□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 NDUFS3O75489 264 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms