RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 PDE7BQ9NP56 450 aa23.28■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 POLG2Q9UHN1 485 aa23.28■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 POMT2Q9UKY4 750 aa23.28■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 CTAGE9A4FU28 777 aa23.27■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 EBLN1P0CF75 366 aa23.27■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 FGF5P12034 268 aa23.27■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 CDH3P22223 829 aa23.27■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 AOAHP28039 575 aa23.27■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 ACY1Q03154 408 aa23.27■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 TUBB3Q13509 450 aa23.27■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa23.27■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa23.27■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 PPP1R3BQ86XI6 285 aa23.27■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 CREG2Q8IUH2 290 aa23.27■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 OR5K2Q8NHB8 316 aa23.27■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 TCF12Q99081 682 aa23.27■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 SOHLH2Q9NX45 425 aa23.27■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 PCYOX1Q9UHG3 505 aa23.27■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 RARRES3Q9UL19 164 aa23.27■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa23.27■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa23.27■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 GPC4O75487 556 aa23.26■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 DLGAP3O95886 979 aa23.26■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF28P17035 718 aa23.26■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 WT1P19544 449 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 SHMT2P34897 504 aa23.26■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 PTK6Q13882 451 aa23.26■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 TYSND1Q2T9J0 566 aa23.26■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 TMTC4Q5T4D3 741 aa23.26■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 NEPROQ6NW34 567 aa23.26■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 VRK3Q8IV63 474 aa23.26■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 D2HGDHQ8N465 521 aa23.26■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 SLCO2A1Q92959 643 aa23.26■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 C1GALT1Q9NS00 363 aa23.26■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 ICKQ9UPZ9 632 aa23.26■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 CDYLQ9Y232 598 aa23.26■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa23.26■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa23.25■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 C2orf74A8MZ97 194 aa23.25■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 ERVH48-1M5A8F1 160 aa23.25■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 KDM1AO60341 852 aa23.25■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 SPAG6O75602 509 aa23.25■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 KIAA0754O94854 1291 aa23.25■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 LIFP15018 202 aa23.25■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 OGNP20774 298 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
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SMKR1-201ENST00000462322 KLHL7Q8IXQ5 586 aa23.25■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa23.25■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 ESX1Q8N693 406 aa23.25■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 CFAP61Q8NHU2 1237 aa23.25■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 GSDMBQ8TAX9 411 aa23.25■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 LPGAT1Q92604 370 aa23.25■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 FGF21Q9NSA1 209 aa23.25■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 ACTR10Q9NZ32 417 aa23.25■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa23.25■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa23.25■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 KPNA5O15131 536 aa23.24■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 SLCO2B1O94956 709 aa23.24■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 PTGIRP43119 386 aa23.24■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 ABHD18Q0P651 414 aa23.24■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 MAP7Q14244 749 aa23.24■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 CTSL3PQ5NE16 218 aa23.24■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 UNC5AQ6ZN44 842 aa23.24■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 OTOAQ7RTW8 1153 aa23.24■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM135Q86UB9 458 aa23.24■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 GALNT6Q8NCL4 622 aa23.24■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 SIGLEC10Q96LC7 697 aa23.24■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 BIRC8Q96P09 236 aa23.24■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 PLAGL1Q9UM63 463 aa23.24■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 BTRCQ9Y297 605 aa23.24■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 CRYL1Q9Y2S2 319 aa23.24■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa23.23■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa23.23■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 PIPSLA2A3N6 862 aa23.23■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 H3BMM5 538 aa23.23■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 ESR1P03372 595 aa23.23■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 RPN2P04844 631 aa23.23■■□□□ 1.31
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