RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 TMPRSS15P98073 1019 aa25.52■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 OLIG2Q13516 323 aa25.52■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 SSPNQ14714 243 aa25.52■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 MRGPREQ86SM8 312 aa25.52■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa25.52■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa25.52■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 HEMGNQ9BXL5 484 aa25.52■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 KLHL25Q9H0H3 589 aa25.52■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 C10orf88Q9H8K7 445 aa25.52■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa25.52■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 KLHL41O60662 606 aa25.51■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 CD63P08962 238 aa25.51■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 GSTM1P09488 218 aa25.51■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 PSMB4P28070 264 aa25.51■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 GSTM4Q03013 218 aa25.51■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 RAPSNQ13702 412 aa25.51■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 KYNUQ16719 465 aa25.51■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa25.51■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa25.51■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa25.51■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 SPESP1Q6UW49 350 aa25.51■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 HOOK3Q86VS8 718 aa25.51■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 PHC3Q8NDX5 983 aa25.51■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP25.51■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 NRTNQ99748 197 aa25.51■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 HGH1Q9BTY7 390 aa25.51■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa25.51■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 SEC16AO15027 2179 aa25.51■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa25.51■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 WIPF3A6NGB9 483 aa25.5■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 ALPPP05187 535 aa25.5■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 ACRV1P26436 265 aa25.5■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 PDHA2P29803 388 aa25.5■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 MC4RP32245 332 aa25.5■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 CCDC181Q5TID7 509 aa25.5■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 CNGA4Q8IV77 575 aa25.5■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 CLEC1AQ8NC01 280 aa25.5■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 C19orf60Q96EN9 201 aa25.5■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 TCTN2Q96GX1 697 aa25.5■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa25.5■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 XKR8Q9H6D3 395 aa25.5■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa25.49■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 PEX12O00623 359 aa25.49■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 KRT86O43790 486 aa25.49■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 OR2B3O76000 313 aa25.49■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 STK10O94804 968 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 FOLR3P41439 243 aa25.49■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 COPS2P61201 443 aa25.49■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 PRKG2Q13237 762 aa25.49■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 MYBPC3Q14896 1274 aa25.49■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 NR6A1Q15406 480 aa25.49■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 DCAF10Q5QP82 559 aa25.49■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 MLIPQ5VWP3 458 aa25.49■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa25.49■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 RHBDD2Q6NTF9 364 aa25.49■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 C11orf63Q6NUN7 778 aa25.49■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 IGFL3Q6UXB1 125 aa25.49■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 ACTL9Q8TC94 416 aa25.49■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 PROKR1Q8TCW9 393 aa25.49■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 KRT35Q92764 455 aa25.49■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 LRRC45Q96CN5 670 aa25.49■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 TBL1YQ9BQ87 522 aa25.49■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 ARNT2Q9HBZ2 717 aa25.49■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa25.49■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 FER1L5A0AVI2 2057 aa25.48■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 H3BMH7 237 aa25.48■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 H7C0S8 307 aa25.48■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 LDB2O43679 373 aa25.48■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 IPO13O94829 963 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 CBX6O95503 412 aa25.48■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 LDLRP01130 860 aa25.48■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 CBSLP0DN79 551 aa25.48■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 SHMT2P34897 504 aa25.48■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 CBSP35520 551 aa25.48■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 MAGEA1P43355 309 aa25.48■■□□□ 1.67
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PBRM1-218ENST00000458294 GALNT16Q8N428 558 aa25.48■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 FAM60AQ9NP50 221 aa25.48■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 ASF1BQ9NVP2 202 aa25.48■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 NDOR1Q9UHB4 597 aa25.48■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 ICKQ9UPZ9 632 aa25.48■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 EFR3BQ9Y2G0 817 aa25.48■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 MYO9AB2RTY4 2548 aa25.47■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 CCL22O00626 93 aa25.47■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PBRM1-218ENST00000458294 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa25.47■■□□□ 1.67
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