RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 KLHL41O60662 606 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 ALOX12BO75342 701 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 OR2B3O76000 313 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 IPO13O94829 963 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 AGTP01019 485 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 EPOP01588 193 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 IGHEP01854 428 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 ITGALP20701 1170 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 ARHGAP25P42331 645 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 NR2C2P49116 596 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 PRLHRP49683 370 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 GEMP55040 296 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 FOXL2P58012 376 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 PRKG2Q13237 762 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 SSPNQ14714 243 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 MYBPC3Q14896 1274 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 SPESP1Q6UW49 350 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 AMIGO1Q86WK6 493 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 RHOT2Q8IXI1 618 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 PHC3Q8NDX5 983 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 OR13C4Q8NGS5 318 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 RANBP9Q96S59 729 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 PITPNM3Q9BZ71 974 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 COG4Q9H9E3 785 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 VPS37BQ9H9H4 285 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 IGSF5Q9NSI5 407 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 SPTLC3Q9NUV7 552 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 P4HTMQ9NXG6 502 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 IFNKQ9P0W0 207 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 CDYLQ9Y232 598 aa9.97□□□□□ -0.81
DDX39B-211ENST00000449757 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.811e-10■□□□□ 9.4
DDX39B-211ENST00000449757 H7C0C1 242 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 CCL22O00626 93 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 TPM3P06753 285 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 COMTP21964 271 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 HADHAP40939 763 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 CDKN2BP42772 138 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 SLC1A1P43005 524 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 ATP5OP48047 213 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 PER3P56645 1201 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 DCDP81605 110 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 OLIG2Q13516 323 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 CCDC181Q5TID7 509 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 LRRC38Q5VT99 294 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 C1QL3Q5VWW1 255 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 CUZD1Q86UP6 607 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 INPP5DQ92835 1189 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 MARVELD3Q96A59 401 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 GBP5Q96PP8 586 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 VAT1Q99536 393 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 COPS8Q99627 209 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 GBA3Q9H227 469 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 MVB12BQ9H7P6 319 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 C10orf88Q9H8K7 445 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 OSGIN2Q9Y236 505 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 NTNG1Q9Y2I2 539 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 SYCE3A1L190 88 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 WIPF3A6NGB9 483 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 LRRTM2O43300 516 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 PSTPIP1O43586 416 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 SGTAO43765 313 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 ANXA9O76027 345 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 CRTAMO95727 393 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 MSL3P1P0C860 447 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 UGT2B7P16662 529 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 PDHA2P29803 388 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 MC4RP32245 332 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 HIF1AQ16665 826 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 SYTL3Q4VX76 610 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 TFDP3Q5H9I0 405 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 TAS2R42Q7RTR8 314 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 SNX20Q7Z614 316 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 TICAM1Q8IUC6 712 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 NXPE1Q8N323 547 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 OR2Y1Q8NGV0 311 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 PROKR1Q8TCW9 393 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms