RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 RARRES3Q9UL19 164 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 TCP11X1B4DZS4 312 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 EREGO14944 169 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 BUD23O43709 281 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 POP7O75817 140 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 CEACAM4O75871 244 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 LCA5LO95447 670 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 NDST3O95803 873 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 CLDN1O95832 211 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 MT-ND3P03897 115 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 SERPING1P05155 500 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 PGDP52209 483 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
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HOXD8-202ENST00000429017 AP1B1Q10567 949 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 ABRQ12979 859 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 PTPRCAPQ14761 206 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 CHRNA6Q15825 494 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
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HOXD8-202ENST00000429017 SLC9A4Q6AI14 798 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 KDELC1Q6UW63 502 aa6.38□□□□□ -1.39
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HOXD8-202ENST00000429017 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 D2HGDHQ8N465 521 aa6.38□□□□□ -1.39
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HOXD8-202ENST00000429017 FDCSPQ8NFU4 85 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 THAP4Q8WY91 577 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 UBXN4Q92575 508 aa6.38□□□□□ -1.39
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HOXD8-202ENST00000429017 C19orf60Q96EN9 201 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 TCTN2Q96GX1 697 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 OLFM3Q96PB7 478 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 FCRL4Q96PJ5 515 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 NUDT9Q9BW91 350 aa6.38□□□□□ -1.39
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HOXD8-202ENST00000429017 SLC25A51Q9H1U9 297 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 CHST8Q9H2A9 424 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 GLOD4Q9HC38 313 aa6.38□□□□□ -1.39
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HOXD8-202ENST00000429017 IL26Q9NPH9 171 aa6.38□□□□□ -1.39
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HOXD8-202ENST00000429017 RORAP35398 523 aa6.37□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
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HOXD8-202ENST00000429017 SLC6A19Q695T7 634 aa6.37□□□□□ -1.39
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HOXD8-202ENST00000429017 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa6.37□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
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HOXD8-202ENST00000429017 CACNA1DQ01668 2161 aa6.37□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
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