RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427193.1

C9orf3-205, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 704 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-205ENST00000427193 FAM71BQ8TC56 605 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 CLEC4CQ8WTT0 213 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 OVCA2Q8WZ82 227 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 PIGKQ92643 395 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 PSMG2Q969U7 264 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 SLC25A28Q96A46 364 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 PGLYRP2Q96PD5 576 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 NPY6RQ99463 290 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 TUBB6Q9BUF5 446 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 MIS12Q9H081 205 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 NMUR1Q9HB89 426 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 MLXIPLQ9NP71 852 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 PARVAQ9NVD7 372 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 OSER1Q9NX31 292 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 CLIC5Q9NZA1 410 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 YIPF1Q9Y548 306 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 ASB3Q9Y575 518 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 INSL5Q9Y5Q6 135 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 F5P12259 2224 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF840PA6NDX5 716 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 SLC38A8A6NNN8 435 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 TMCO5BA8MYB1 307 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 I6L893 689 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 KRT86O43790 486 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 HSF2BPO75031 334 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 LRCH4O75427 683 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 PROSCO94903 275 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 SYF2O95926 243 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 GLUD1P00367 558 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 IGLV3-27P01718 113 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 KRT3P12035 628 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 EPCAMP16422 314 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 ABCB4P21439 1286 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 PCK1P35558 622 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 MATKP42679 507 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 TUBP50607 506 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 DGKQP52824 942 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 LIMK1P53667 647 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 SNX16P57768 344 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 ADIGQ0VDE8 80 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 TAZQ16635 292 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 CCDC14Q49A88 953 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 EFHC1Q5JVL4 640 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 CYP4A22Q5TCH4 519 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 LRRC38Q5VT99 294 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 SYPL2Q5VXT5 272 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 PLPP4Q5VZY2 271 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 NT5DC3Q86UY8 548 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 MON1AQ86VX9 555 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 PJA1Q8NG27 643 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF653Q96CK0 615 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 SLC39A13Q96H72 371 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 HES6Q96HZ4 224 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 WDR24Q96S15 920 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 CNPY3Q9BT09 278 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 NUP85Q9BW27 656 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 ULBP1Q9BZM6 244 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 TSGA10Q9BZW7 698 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 FBXO44Q9H4M3 255 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 DECR2Q9NUI1 292 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF212Q9UDV6 495 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 LCMT1Q9UIC8 334 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 RAB23Q9ULC3 237 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 CA14Q9ULX7 337 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 CEP83Q9Y592 693 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 ALG6Q9Y672 507 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 SCINQ9Y6U3 715 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 NOTCH4Q99466 2003 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 TENM4Q6N022 2769 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 GREB1Q4ZG55 1949 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 DOCK8Q8NF50 2099 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 SLC22A23A1A5C7 686 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 A6NNZ2 444 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 CTIFO43310 598 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 DAB1O75553 588 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 OAS1P00973 400 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 RETP07949 1114 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 CSH1P0DML2 217 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 CSH2P0DML3 217 aa5.54□□□□□ -1.52
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