RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPACA3Q8IXA5 215 aa8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KLHL7Q8IXQ5 586 aa8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RCBTB1Q8NDN9 531 aa8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPATA4Q8NEY3 305 aa8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC22A18Q96BI1 424 aa8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC41A2Q96JW4 573 aa8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TGM7Q96PF1 710 aa8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FERD3LQ96RJ6 166 aa8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM129AQ9BZQ8 928 aa8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SRMSQ9H3Y6 488 aa8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FANCEQ9HB96 536 aa8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PDE7BQ9NP56 450 aa8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM114A2Q9NRY5 505 aa8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HRASLS2Q9NWW9 162 aa8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC39A1Q9NY26 324 aa8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WHRNQ9P202 907 aa8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM8A1Q9UBU6 413 aa8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 POMT2Q9UKY4 750 aa8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BTRCQ9Y297 605 aa8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADAMTS20P59510 1910 aa8.34□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SDK2Q58EX2 2172 aa8.34□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C2orf72A6NCS6 295 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF839A8K0R7 811 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EFCAB7A8K855 629 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EFCAB8A8MWE9 144 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C9orf172C9J069 976 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 E5RI56 91 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GOLGA8MH3BSY2 632 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SEC16AO15027 2179 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AVILO75366 819 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MT-ND3P03897 115 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CBSLP0DN79 551 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PKMP14618 531 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ITIH1P19827 911 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CD9P21926 228 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PDHA2P29803 388 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CBSP35520 551 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PREPP48147 710 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARL4DP49703 201 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RAB28P51157 221 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GFERP55789 205 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HSD11B2P80365 405 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HSPA14Q0VDF9 509 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GBX1Q14549 363 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SEMA3AQ14563 771 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIR2DS3Q14952 304 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UGT3A1Q6NUS8 523 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SYT10Q6XYQ8 523 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CEP128Q6ZU80 1094 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCNMB4Q86W47 210 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AMIGO1Q86WK6 493 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DTX1Q86Y01 620 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CNTN4Q8IWV2 1026 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR52E1Q8NGJ3 308 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 USP7Q93009 1102 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ART4Q93070 314 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RAD51AP1Q96B01 352 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BIRC8Q96P09 236 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PITPNM3Q9BZ71 974 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM9Q9P0T7 183 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPATA7Q9P0W8 599 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRSS21Q9Y6M0 314 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZFHX4Q86UP3 3567 aa8.33□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa8.32□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa8.32□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PIPSLA2A3N6 862 aa8.32□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR6C74A6NCV1 312 aa8.32□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 E7ESA3 106 aa8.32□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CASC3O15234 703 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FANCGO15287 622 aa8.32□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TTI1O43156 1089 aa8.32□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KLK10O43240 276 aa8.32□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRAMEF10O60809 474 aa8.32□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 S1PR4O95977 384 aa8.32□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GSTA2P09210 222 aa8.32□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FGF5P12034 268 aa8.32□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCL4P13236 92 aa8.32□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HGFP14210 728 aa8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms