RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 H0Y3Z8 333 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 CHEK2O96017 543 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 CBSLP0DN79 551 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 PCNAP12004 261 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 VCLP18206 1134 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 CBSP35520 551 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 CCR3P51677 355 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 RELAQ04206 551 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 GRM2Q14416 872 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 GRIN2CQ14957 1233 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 ACOX1Q15067 660 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 PHKG1Q16816 387 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 CCDC81Q6ZN84 652 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 SYVN1Q86TM6 617 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 SFTPA1Q8IWL2 248 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 YAF2Q8IY57 180 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 TRAM1L1Q8N609 369 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 PDPRQ8NCN5 879 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 RCN3Q96D15 328 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 AKTIPQ9H8T0 292 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 LMNAP02545 664 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC00032P0C843 101 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 UROSP10746 265 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 CHRNB1P11230 501 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 MSH3P20585 1137 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 CCR7P32248 378 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 METAP1P53582 386 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 STX1BP61266 288 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 FCHO2Q0JRZ9 810 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 HSPA14Q0VDF9 509 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 RUNX3Q13761 415 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF234Q14588 700 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 STK11Q15831 433 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 C9orf64Q5T6V5 341 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 C1orf146Q5VVC0 180 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 ALKBH2Q6NS38 261 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 ANKRD54Q6NXT1 300 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 SYCE2Q6PIF2 218 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 LIPIQ6XZB0 460 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 GK5Q6ZS86 529 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 TRIML2Q8N7C3 387 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 KYQ8NBH2 561 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 OR52B6Q8NGF0 335 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 STMN2Q93045 179 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 TUBGCP3Q96CW5 907 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 FERD3LQ96RJ6 166 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF382Q96SR6 550 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 TUBB1Q9H4B7 451 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 WWOXQ9NZC7 414 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF225Q9UK10 706 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 SATB2Q9UPW6 733 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 FADS2P1A8MWK0 482 aa9.79□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 PDE5AO76074 875 aa9.79□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 ITGB7P26010 798 aa9.79□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 HSPA7P48741 367 aa9.79□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 EMP3P54852 163 aa9.79□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 PKNOX1P55347 436 aa9.79□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 B2MP61769 119 aa9.79□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 HYAL1Q12794 435 aa9.79□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 GTF2H2Q13888 395 aa9.79□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 MAPRE2Q15555 327 aa9.79□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa9.79□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 FBXL19Q6PCT2 694 aa9.79□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 C16orf89Q6UX73 402 aa9.79□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa9.79□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa9.79□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 TMIEQ8NEW7 156 aa9.79□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 CFAP61Q8NHU2 1237 aa9.79□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 DTX3LQ8TDB6 740 aa9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms