RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 A0A1B0GVM2 712 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 ANKRD34BA5PLL1 514 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM88BA6NKF7 163 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 AXIN1O15169 862 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 ADAM12O43184 909 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 STC2O76061 302 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 SLC10A3P09131 477 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 C7P10643 843 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 PTPN2P17706 415 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 SHMT2P34897 504 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 CLCN7P51798 805 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 SREBF2Q12772 1141 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 GTF2H2Q13888 395 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 SELPLGQ14242 412 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 AP5B1Q2VPB7 878 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 BROXQ5VW32 411 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 TBPL2Q6SJ96 375 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 FBXO22Q8NEZ5 403 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 CAPSLQ8WWF8 208 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 NRBF2Q96F24 287 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 MUS81Q96NY9 551 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 ZIC5Q96T25 663 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 FUNDC2Q9BWH2 189 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 TTLL2Q9BWV7 592 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 CHD5Q8TDI0 1954 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF840PA6NDX5 716 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 H0Y626 953 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 NPPAP01160 153 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 PCNAP12004 261 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 SLC2A4P14672 509 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 PSMA3P25788 255 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 ARF5P84085 180 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 CACNG1Q06432 222 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 CRTC3Q6UUV7 619 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 CYP2U1Q7Z449 544 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 MILR1Q7Z6M3 343 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 STK40Q8N2I9 435 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 CARNMT1Q8N4J0 409 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 C17orf80Q9BSJ5 609 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 RETREG1Q9H6L5 497 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 IPPKQ9H8X2 491 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 MTRRQ9UBK8 725 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 DHRS7Q9Y394 339 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 GOLGA8CPA6NN73 597 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 OR7A17O14581 309 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 TBC1D4O60343 1298 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 PRAMEF12O95522 483 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 ALBP02768 609 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 CD9P21926 228 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 NR4A2P43354 598 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 HSPA7P48741 367 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 RHOAP61586 193 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 TUBA3CQ13748 450 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 ABRAXAS2Q15018 415 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 TAF12Q16514 161 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 NDUFA5Q16718 116 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 ADGRF1Q5T601 910 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 NCEH1Q6PIU2 408 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 FAM151BQ6UXP7 276 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 DLEU7Q6UYE1 221 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 MINDY2Q8NBR6 621 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 DBF4BQ8NFT6 615 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 ITFG1Q8TB96 612 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 FKBP10Q96AY3 582 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 PLD4Q96BZ4 506 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 DGCR6LQ9BY27 220 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 HEBP1Q9NRV9 189 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 IFT52Q9Y366 437 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 H0Y858 1186 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 GSTA4O15217 222 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 FFAR2O15552 330 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 ABCB7O75027 752 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 UGT2B4P06133 528 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 ALPIP09923 528 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 HTR1BP28222 390 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 OR1D2P34982 312 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-202ENST00000375175 PIK3CGP48736 1102 aa12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms