RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 LMX1BO60663 402 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 TBCAO75347 108 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 SP1P08047 785 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 FGF5P12034 268 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 CPT2P23786 658 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 DNASE1P24855 282 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 EPHA2P29317 976 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 GABRA5P31644 462 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 CDH13P55290 713 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 BRWD1-AS2P59051 145 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 HILS1P60008 231 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 KCNJ10P78508 379 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 ARL16Q0P5N6 197 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 PTPRCAPQ14761 206 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 KYNUQ16719 465 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 CRY2Q49AN0 593 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 LCE1FQ5T754 118 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC27A1Q6PCB7 646 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 FIGLAQ6QHK4 219 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 C19orf48Q6RUI8 117 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 PLXDC2Q6UX71 529 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 ATG9AQ7Z3C6 839 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF554Q86TJ5 538 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 ISCA2Q86U28 154 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 COMMD2Q86X83 199 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 NME8Q8N427 588 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 MOB3AQ96BX8 217 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 NXNL1Q96CM4 212 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 SPDL1Q96EA4 605 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 ARSGQ96EG1 525 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 SPATA17Q96L03 361 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 SGK494Q96LW2 274 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 GBP5Q96PP8 586 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 MYADMQ96S97 322 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 PITPNM3Q9BZ71 974 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 MMP28Q9H239 520 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 SLA2Q9H6Q3 261 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 TBC1D17Q9HA65 648 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 NPAP1Q9NZP6 1156 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 TCF19Q9Y242 345 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 A0A1W2PN81 502 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 OR6C76A6NM76 312 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 XPNPEP2O43895 674 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 CREG1O75629 220 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC22A3O75751 556 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 C22orf31O95567 290 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 HSPA4P34932 840 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 CHRNA7P36544 502 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 PRKCZQ05513 592 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 RUNX1T1Q06455 604 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 MDH1BQ5I0G3 518 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 C6orf163Q5TEZ5 329 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 PLA2G4FQ68DD2 849 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 C11orf63Q6NUN7 778 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF449Q6P9G9 518 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 TEX38Q6PEX7 206 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 LINGO4Q6UY18 593 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 CDK20Q8IZL9 346 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 STPG4Q8N801 248 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF611Q8N823 705 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 KBTBD3Q8NAB2 608 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 OR2T12Q8NG77 320 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 OR6J1Q8NGC5 347 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 LRRC8CQ8TDW0 803 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 CENPTQ96BT3 561 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 C17orf77Q96MU5 243 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 EGFL8Q99944 293 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 RHNO1Q9BSD3 238 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 NUP85Q9BW27 656 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 PRRG4Q9BZD6 226 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 HAO2Q9NYQ3 351 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 RHCGQ9UBD6 479 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
SNORD3E-201ENST00000362899 CTAGE9A4FU28 777 aa2.71□□□□□ -1.98
SNORD3E-201ENST00000362899 CLDN4O14493 209 aa2.71□□□□□ -1.98
SNORD3E-201ENST00000362899 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
SNORD3E-201ENST00000362899 PCDH7O60245 1069 aa2.71□□□□□ -1.98
SNORD3E-201ENST00000362899 ADRB2P07550 413 aa2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms