RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
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SOCS1-201ENST00000332029 LINC00523Q86TU6 105 aa20.48■□□□□ 0.87
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SOCS1-201ENST00000332029 CLDN19Q8N6F1 224 aa20.48■□□□□ 0.87
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SOCS1-201ENST00000332029 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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SOCS1-201ENST00000332029 TCFL5Q9UL49 500 aa20.46■□□□□ 0.87
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa20.46■□□□□ 0.87
SOCS1-201ENST00000332029 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa20.46■□□□□ 0.87
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SOCS1-201ENST00000332029 C4orf17Q53FE4 359 aa20.45■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 FAM69BQ5VUD6 431 aa20.45■□□□□ 0.86
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SOCS1-201ENST00000332029 OR1L3Q8NH93 324 aa20.45■□□□□ 0.86
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SOCS1-201ENST00000332029 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.45■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 ETNK1Q9HBU6 452 aa20.45■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 SYTL2Q9HCH5 934 aa20.45■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 PCMTD2Q9NV79 361 aa20.45■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa20.45■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa20.44■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
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SOCS1-201ENST00000332029 MSL3P1P0C860 447 aa20.44■□□□□ 0.86
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SOCS1-201ENST00000332029 FDFT1P37268 417 aa20.44■□□□□ 0.86
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SOCS1-201ENST00000332029 ITIH4Q14624 930 aa20.44■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF789Q5FWF6 425 aa20.44■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 FAM198BQ6UWH4 519 aa20.44■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF662Q6ZS27 426 aa20.44■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 SYTL1Q8IYJ3 562 aa20.44■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 OR52E1Q8NGJ3 308 aa20.44■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 NRTNQ99748 197 aa20.44■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF148Q9UQR1 794 aa20.44■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 PRSS21Q9Y6M0 314 aa20.44■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 TEX15Q9BXT5 2789 aa20.44■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC162PA2VCL2 907 aa20.43■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 OR51F1A6NGY5 319 aa20.43■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 QSOX1O00391 747 aa20.43■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 BTN3A1O00481 513 aa20.43■□□□□ 0.86
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