RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329151.5

TMEM54-201, Transcript of transmembrane protein 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM54, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54-201ENST00000329151 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa22.61■■□□□ 1.21
TMEM54-201ENST00000329151 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
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TMEM54-201ENST00000329151 A6NL46 340 aa22.6■■□□□ 1.21
TMEM54-201ENST00000329151 F8W8V4 182 aa22.6■■□□□ 1.21
TMEM54-201ENST00000329151 BTN3A3O00478 584 aa22.6■■□□□ 1.21
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF185O15231 689 aa22.6■■□□□ 1.21
TMEM54-201ENST00000329151 GAS8O95995 478 aa22.6■■□□□ 1.21
TMEM54-201ENST00000329151 CACNG1Q06432 222 aa22.6■■□□□ 1.21
TMEM54-201ENST00000329151 P3H1Q32P28 736 aa22.6■■□□□ 1.21
TMEM54-201ENST00000329151 PTCHD3Q3KNS1 767 aa22.6■■□□□ 1.21
TMEM54-201ENST00000329151 NADK2Q4G0N4 442 aa22.6■■□□□ 1.21
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TMEM54-201ENST00000329151 UBL4BQ8N7F7 174 aa22.6■■□□□ 1.21
TMEM54-201ENST00000329151 CLEC18CQ8NCF0 446 aa22.6■■□□□ 1.21
TMEM54-201ENST00000329151 SLC29A3Q9BZD2 475 aa22.6■■□□□ 1.21
TMEM54-201ENST00000329151 ARNT2Q9HBZ2 717 aa22.6■■□□□ 1.21
TMEM54-201ENST00000329151 PCMTD2Q9NV79 361 aa22.6■■□□□ 1.21
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TMEM54-201ENST00000329151 ACTR10Q9NZ32 417 aa22.6■■□□□ 1.21
TMEM54-201ENST00000329151 ICE1Q9Y2F5 2266 aa22.59■■□□□ 1.21
TMEM54-201ENST00000329151 PSMD3O43242 534 aa22.59■■□□□ 1.21
TMEM54-201ENST00000329151 LDB2O43679 373 aa22.59■■□□□ 1.21
TMEM54-201ENST00000329151 AP2A2O94973 939 aa22.59■■□□□ 1.21
TMEM54-201ENST00000329151 FTH1P02794 183 aa22.59■■□□□ 1.21
TMEM54-201ENST00000329151 MSL3P1P0C860 447 aa22.59■■□□□ 1.21
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TMEM54-201ENST00000329151 PARP6Q2NL67 630 aa22.59■■□□□ 1.21
TMEM54-201ENST00000329151 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa22.59■■□□□ 1.21
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TMEM54-201ENST00000329151 PITPNM3Q9BZ71 974 aa22.59■■□□□ 1.21
TMEM54-201ENST00000329151 XKR8Q9H6D3 395 aa22.59■■□□□ 1.21
TMEM54-201ENST00000329151 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
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TMEM54-201ENST00000329151 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
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TMEM54-201ENST00000329151 ZNF749O43361 778 aa22.58■■□□□ 1.21
TMEM54-201ENST00000329151 ATXN8OSP0DMR3 200 aa22.58■■□□□ 1.21
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TMEM54-201ENST00000329151 TPH1P17752 444 aa22.58■■□□□ 1.21
TMEM54-201ENST00000329151 PDHA2P29803 388 aa22.58■■□□□ 1.21
TMEM54-201ENST00000329151 OTX2P32243 289 aa22.58■■□□□ 1.21
TMEM54-201ENST00000329151 RORAP35398 523 aa22.58■■□□□ 1.21
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TMEM54-201ENST00000329151 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
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TMEM54-201ENST00000329151 KIAA1328Q86T90 577 aa22.58■■□□□ 1.21
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TMEM54-201ENST00000329151 H7C0S8 307 aa22.57■■□□□ 1.2
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TMEM54-201ENST00000329151 UQCRFS1P47985 274 aa22.57■■□□□ 1.2
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TMEM54-201ENST00000329151 BRD3Q15059 726 aa22.57■■□□□ 1.2
TMEM54-201ENST00000329151 MLIPQ5VWP3 458 aa22.57■■□□□ 1.2
TMEM54-201ENST00000329151 LCN10Q6JVE6 187 aa22.57■■□□□ 1.2
TMEM54-201ENST00000329151 FAM198BQ6UWH4 519 aa22.57■■□□□ 1.2
TMEM54-201ENST00000329151 PEX26Q7Z412 305 aa22.57■■□□□ 1.2
TMEM54-201ENST00000329151 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.57■■□□□ 1.2
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TMEM54-201ENST00000329151 FAM71DQ8N9W8 422 aa22.57■■□□□ 1.2
TMEM54-201ENST00000329151 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa22.57■■□□□ 1.2
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TMEM54-201ENST00000329151 PANX2Q96RD6 677 aa22.57■■□□□ 1.2
TMEM54-201ENST00000329151 MFRPQ9BY79 579 aa22.57■■□□□ 1.2
TMEM54-201ENST00000329151 TXLNGQ9NUQ3 528 aa22.57■■□□□ 1.2
TMEM54-201ENST00000329151 NDOR1Q9UHB4 597 aa22.57■■□□□ 1.2
TMEM54-201ENST00000329151 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa22.56■■□□□ 1.2
TMEM54-201ENST00000329151 SOWAHDA6NJG2 315 aa22.56■■□□□ 1.2
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TMEM54-201ENST00000329151 IGHEP01854 428 aa22.56■■□□□ 1.2
TMEM54-201ENST00000329151 OR56A5P0C7T3 313 aa22.56■■□□□ 1.2
TMEM54-201ENST00000329151 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
TMEM54-201ENST00000329151 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
TMEM54-201ENST00000329151 ATP1A4Q13733 1029 aa22.56■■□□□ 1.2
TMEM54-201ENST00000329151 C4orf17Q53FE4 359 aa22.56■■□□□ 1.2
TMEM54-201ENST00000329151 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
TMEM54-201ENST00000329151 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa22.56■■□□□ 1.2
TMEM54-201ENST00000329151 LINC00523Q86TU6 105 aa22.56■■□□□ 1.2
TMEM54-201ENST00000329151 DNAAF3Q8N9W5 541 aa22.56■■□□□ 1.2
TMEM54-201ENST00000329151 FDCSPQ8NFU4 85 aa22.56■■□□□ 1.2
TMEM54-201ENST00000329151 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa22.56■■□□□ 1.2
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